Un découpage de l'agro-écosystème en composantes correspondant aux compétences nécessaires à son étude est d'abord proposé, permettant de situer les interfaces entre les différentes disciplines. A partir des problématiques de deux régions, au Brésil et au Mexique, les raisons qui amènent une équipe d'agronomes à souhaiter coupler des modèles socio-économiques aux modèles biophysiques sont exposées. Une démarche progressive de construction de modèles biophysiques est décrite, puis illustrée par l'exemple d'une recherche menée au Sénégal. Dans cet exemple, il apparaît que certains aspects du modèle construit auraient permis d'améliorer des études réalisées par ailleurs par des socio-économistes qui ont eu recours à des modèles plus simples. En revanche, certains autres aspects du modèle rendent difficile son couplage aux modèles socio-économiques. Ceci suggère que pour faciliter le couplage des deux types de modèles, il est souhaitable que leur construction soit le fruit d'une collaboration étroite entre les disciplines