L'étude du polymorphisme de la longueur des fragments de restriction sur 20 loci a permis de mettre en évidence une forte différenciation des populations de Mycosphaerella sp. provenant des différentes régions de production bananière. Cette différence est la conséquence d'une dérive génétique au travers des effets de fondation lors de l'expansion de la maladie des raies noires. Une diversité importante est détectée dans le Sud Est asiatique (Papouasie Nouvelle Guinée et Philippines). Ce centre pourrait se superposer avec celui du bananier. Une diversité importante est également retrouvée chez Phytophthora infestans dans le centre d'origine de ce pathogène tant pour des marqueurs génétiques neutres que pour la virulence