Le programme d'amélioration génétique du CRBP inclue la gestion du germplasm, la création de cultivars par hybridation et l'amélioration de la résistance à la cercosporiose noire (CN). Ses principaux objectifs sont l'identification des variétés résistantes aux principaux ravageurs et maladies (surtout CN) et l'amélioration des systèmes de culture. Des plantains ont été tout d'abord hybridés avec Calcutta 4 pour cribler la fertilité femelle. La recherche de résistance à la CN nécessite la caractérisation des réactions et de la résisitance de nouvelles accessions à travers un criblage précoce des plantules, un criblage au champ et le contrôle du matériel amélioré. Différents types de relations selon l'hôte ont été observés. L'homozgotie dans les diploïdes sauvages et les mécanismes de transmission des caractères ont été étudiés pour déterminer les bases génétiques de la résistance. En appui à ce programmme, le CRBP dispose d'un laboratoire de culture in vitro depuis 1992.