Une carte génétique haute densité a été récemment construite à l'aide de marqueurs RFLP et AFLP majoritairement. Afin de pouvoir disposer de marqueurs ancres facilement utilisables et permettant de comparer aisément différentes cartes génétiques entre elles, de nouveaux marqueurs microsatellites ont été produits et cartographiés sur la carte de référence. Ces marqueurs sont très polymorphes, co-dominant et ne nécessitent que peu d'ADN pour être révélés. Quatre banques différentes enrichies en marqueurs microsatellites ont été élaborées, et un bon enrichissement a été obtenu (jusqu'à 86% des clones contiennent un microsatellite). Deux cent quatre vingt fragments d'ADN ont été séquencés et 141 séquences uniques exploitables pour la production de microsatellites ont été obtenues. Jusqu'à présent, 40 nouveaux marqueurs microsatellites polymorphes ont été isolés et 30 d'entre eux ont pu être cartographiés sur la carte de référence. Dix neuf autres marqueurs microsatellites produits par Nestlé ont pu être également cartographiés. Au total, 69 microsatellites sont à présent cartographiés sur la carte de référence.