Les Badnavirus appartiennent au groupe des Pararetrovirus (famille Caulimoviridae). Ils infectent de nombreuses plantes tropicales d'intérêt comme le bananier (Banana streak virus, BSV), l'igname (Dioscorea alata bacilliform virus, DaBV), le cacaoyer (Cacao swollen shoot virus, CSSV) ou la canne à sucre (Sugarcane bacilliform virus, SCBV), chez lesquelles ils provoquent la plupart de temps des dégâts importants. De plus, ils constituent actuellement un frein important aux échanges de matériel végétal et à la création variétale, en particulier dans le cas du BSV dont certaines séquences intégrées au génome du bananier sont susceptibles de générer des particules virales à la faveur de stress biotiques ou abiotiques. La mise au point et/ou l'optimisation de méthodes moléculaires de détection nécessitent une bonne connaissance de la variabilité génétique de ces virus. Une telle étude a été entreprise sur des souches de BSV, de DaBV, de CSSV et de SCBV de différentes provenances géographiques, dans la portion de l'ORF3 codant pour la RNase H et la reverse transcriptase. Ces résultats indiquent une importante variabilité moléculaire qui peut représenter jusqu'à 40% de divergence entre deux souches pathogènes d'un même virus. Les implications pour la détection de ces virus ainsi que pour leur taxonomie seront discutées. (Texte intégral)