Genetic diversity of taro (Colocasia esculenta (L.) Schott) assessed by SSR markers
Noyer J.L., Billot C., Brottier P., Quéro Garcia J., Lebot V.. 2004. In : Guarino Luigi (ed.), Taylor Mary B. (ed.), Osborn Tom (ed.). Third Taro Symposium, 21-23 May 2003, Nadi, Fiji Islands : proceedings of an international scientific meeting. Suva : SPC, p. 174-180. Taro Symposium. 3, 2003-05-21/2003-05-23, Nadi (Fidji).
Le criblage de 96 clones extraits d'une banque enrichie en marqueurs microsatellites a permis d'isoler 49 séquences contenant des motifs répétés. Quinze paires d'amorce ont été créées. Toutes ont révélé un polymorphisme (nombre d'allèles compris entre 2 et 8) dans un sous-ensemble de cinq obtentions de taro. Sept paires d'amorce ont été utilisées pour étudier la diversité génétique de 105 obtentions, et ont permis de révéler 100 allèles. Cet échantillon a été constitué pour couvrir toute la diversité génétique de Colocasia esculenta telle que décrite par des membres du Réseau de recherche sur le taro pour l'Asie du Sud-Est et l'Océanie (TANSAO) à l'aide de marqueurs AFLP. Des dendogrammes ont été réalisés grâce à la méthode NJTree (Neighbor Joining Method) fondée sur une matrice de similitude calculée selon un indice de Dice. Le niveau d'hétérosygotie a été calculé malgré la présence d'obtentions diploïdes et triploïdes. Les résultats sont décrits et commentés.
Mots-clés : colocasia esculenta; variation génétique; distance génétique; marqueur génétique; microsatellite; hétérozygote; polymorphisme génétique; aflp
Communication de congrès
Agents Cirad, auteurs de cette publication :
- Billot Claire — Bios / UMR AGAP
- Lebot Vincent — Bios / UMR AGAP