Publications des agents du Cirad

Cirad

Genetic diversity of taro (Colocasia esculenta (L.) Schott) assessed by SSR markers

Noyer J.L., Billot C., Brottier P., Quéro Garcia J., Lebot V.. 2004. In : Guarino Luigi (ed.), Taylor Mary B. (ed.), Osborn Tom (ed.). Third Taro Symposium, 21-23 May 2003, Nadi, Fiji Islands : proceedings of an international scientific meeting. Suva : SPC, p. 174-180. Taro Symposium. 3, 2003-05-21/2003-05-23, Nadi (Fidji).

Le criblage de 96 clones extraits d'une banque enrichie en marqueurs microsatellites a permis d'isoler 49 séquences contenant des motifs répétés. Quinze paires d'amorce ont été créées. Toutes ont révélé un polymorphisme (nombre d'allèles compris entre 2 et 8) dans un sous-ensemble de cinq obtentions de taro. Sept paires d'amorce ont été utilisées pour étudier la diversité génétique de 105 obtentions, et ont permis de révéler 100 allèles. Cet échantillon a été constitué pour couvrir toute la diversité génétique de Colocasia esculenta telle que décrite par des membres du Réseau de recherche sur le taro pour l'Asie du Sud-Est et l'Océanie (TANSAO) à l'aide de marqueurs AFLP. Des dendogrammes ont été réalisés grâce à la méthode NJTree (Neighbor Joining Method) fondée sur une matrice de similitude calculée selon un indice de Dice. Le niveau d'hétérosygotie a été calculé malgré la présence d'obtentions diploïdes et triploïdes. Les résultats sont décrits et commentés.

Mots-clés : colocasia esculenta; variation génétique; distance génétique; marqueur génétique; microsatellite; hétérozygote; polymorphisme génétique; aflp

Communication de congrès

Agents Cirad, auteurs de cette publication :