Dans l'idéal, les chercheurs attendent une implication très forte des paysans à tous les stades du processus de sélection participative. Ils souhaitent que ceux-ci contribuent aux prises de décision comme aux activités de terrain. Toutefois, on ne retrouve pas souvent ce souci dans l'organisation quotidienne des projets. Dans la réalité, chaque acteur cherche d'abord à s'assurer le contrôle de la décision. Le partenariat demande donc un apprentissage préalable et continu qui inclut la mise en évidence d'enjeux communs et de règles partagées.