Certains insectes ravageurs des cultures et des forêts présentent des fluctuations extrêmes et soudaines des densités de leurs populations. Les études évolutives, basées sur des marqueurs moléculaires neutres et/ou des traits populationnels densité-dépendants, sont potentiellement informatives sur (i) la dynamique et la structure des populations pullulantes et (ii) les déterminants populationnels et environnementaux des pullulations de ces insectes nuisibles. De telles études sont cependant rares chez les insectes pullulants, notamment en raison de modalités évolutives de variation des séquences microsatellites à l'origine d'allèles nuls en forte fréquence. Dans cette thèse, nous avons quantifié par simulations informatiques la sur-estimation du niveau de différentiation génétique entre les populations et la sous-estimation du niveau de diversité génétique au sein des populations causées par la présence d'allèles nuls aux marqueurs microsatellites. Nous proposons un estimateur du FsT non biaisé, basé uniquement sur les états visibles dont les fréquences génotypiques ont été modifiées selon la fréquence d'allèles nuls. Cette connaissance sur les allèles nuls aux marqueurs microsatellites a permis une analyse pertinente de la variation génétique à ces marqueurs des populations du criquet migrateur, Locusta migratoria, un insecte pullulant qui présente un changement d'une phase solitaire, inactive et dispersée, à une phase grégaire, très mobile et agrégative, lors des évènements de pullulations. La structuration génétique mondiale de cette espèce cosmopolite s'est révélée largement incongruente avec la classification taxonomique actuelle réalisée sur la base de critères morphométriques et comprenant onze sous-espèces. Des facteurs géographiques, écologiques, et historiques structurent la variation génétique de l'espèce à l'échelle de l'ensemble de son aire de répartition, qui en revanche coïncide peu avec le statut pullulant des populations échantillonnées. A une échel