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Etude de la diversité génétique et du déséquilibre de liaison au sein de populations améliorées de palmier à huile (Elaeis guineensis Jacq.)

Cochard B.. 2008. Montpellier : Montpellier SupAgro, 272 p.. Thèse de doctorat -- Biologie intégrative des plantes.

Pour comprendre la complémentarité entre les origines africaines et les origines "asiatiques" améliorées et pour diversifier la base génétique utilisée dans les programmes de sélection du palmier à huile (Elaeis guineensis Jacq.), la structure des ressources génétiques impliquées dans l'histoire de la sélection du palmier à huile en relation avec le germplasme africain incluant des populations subspontannées nécessite d'être étudiée. Dans cette étude, 14 marqueurs microsatellites (SSR) ont été utilisés. Les analyses descriptives et Bayésiennes de la diversité génétique du palmier à huile (Analyses en Coordonnées Principales, Neighbour-Joining Tree et le logiciel Structure) révèle deux groupes originaux qui reflètent la discontinuité la discontinuité des espèces africaines dans la région de Dahomey-Gap: d'une part l'Afrique de l'ouest (Groupe I) et d'autre part le "Bénin-Nigeria-Cameroun-Congo-Angola" (Groupe II). Dérivant du groupe II, le groupe Deli (Groupe III) est le résultat de la sélection artificielle. La spécificité du groupe I nécessite de l'enrichir par des prospections, en Guinée et au Ghana. La particularité de l'origine Deli étant due au mode de constitution de cette origine, reproduire cette méthodologie à partir d'origines subspontannés peut optimiser l'amélioration génétique du palmier à huile. La structuration suggère, que pour exploiter à la fois la complémentarité entre les groupes I et II et de bénéficier des qualités agronomiques de l'origine Deli, de réaliser des croisements de type (Deli x Yangambi) x La Mé. Afin d'identifier des locus associés à des caractères agronomiques par étude d'association, la caractérisation du déséquilibre de liaison (DL) a été entreprise sur 3 origines améliorées de palmier à huile: La Mé, Yangambi et Deli. 74 marqueurs SSR ont été retenus pour caractériser le DL sur l'ensemble du génome, à raison de 2 couples de locus par groupe de liaison, environ et d'une région ciblée dans les groupes de liaison 8 et 15. Les géné

Mots-clés : elaeis guineensis; côte d'ivoire; angola; bénin; nigéria; république démocratique du congo; cameroun; indonésie; bahia

Thèse

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