De très grandes disparités existent entre les DOM, en ce qui concerne l'environnement agro-écologique, les systèmes d'élevage et les cheptels présents. Ces disparités concernent également les ressources génétiques animales exploitées. Dans les différentes espèces des populations locales originales se sont constituées au cours de l'histoire. Au cours du vingtième siècle, des introductions ont été réalisées pour essayer d'améliorer les performances du cheptel local. Ces tentatives ont connu des résultats mitigés, et quelques races ont réussi à s'implanter de manière durable. La principale conséquence a cependant été la multiplication de croisements non maîtrisés, au détriment des races locales. Ces races locales présentent cependant des aptitudes d'adaptation et de productivité intéressantes. A partir de cette description, les différentes orientations génétiques suivies sont analysées, incluant l'utilisation de races exogènes, la mise en oeuvre de schémas de croisements ou la conservation et la sélection des races locales. Les perspectives d'évolution de ces programmes d'amélioration génétique dans les DOM sont finalement discutées.