A mancha angular, causada pela bactéria Xanthomonas axonopodis pv. malvacearum (Xam), é uma das principais doenças do algodoeiro. Essa doença não tem controle curativo, sendo a resistência genética a forma mais adequada de manejo. Até o presente, foram relatados 22 genes, conferindo diferentes níveis de resistência - completa ou parcial - à 20 raças específicas da bactéria por meio de interação gene a gene. As combinações dos genes B2B3 e B9LB10L foram as mais utilizadas em programas de melhoramento de algodoeiro, visando a resistência a mancha angular. Essas combinações conferem a resistência total à maioria de raças específicas de Xam (até a raça 19) nos países produtores de algodão; entretanto, uma nova raça de Xam (HV1, raça 20) tem superado a resistência resultante da combinação desses genes, sendo o gene B12 o único eficaz contra essa nova raça. Recentemente, um marcador molecular do tipo SSR associado ao gene B12 foi relatado. Objetivos: Investigar as relações genéticas entre fontes de resistência à Xam por meio do genotipagem de acessos de algodoeiro usando um marcador SSR associado ao loco de resistência B12. Métodos: Foram escolhidos 10 acessos de algodoeiro portadores de diversas combinações gênicas para avaliação com o marcador SSR CIR 246, associado a loco de resistência B12: S-295 (B12), 101-102B (B2B3BSm) Empire WR (BSm), Empire WRB4 (B4BSm), Empire WRB2B6 (B2b6BSm), Empire WRB2B3B6 (B2B3b6BSm), Mebane B1 (B2), Tamcot SP37 (B2B3B7), Reba B50 (B9LB10L) e Acala 44 (suscetível, sem genes de resistência), além de um conjunto de variedades comerciais resistentes ou suscetíveis às raças de Xam presentes no Brasil - raças 3, 8, 10, 18 e 19 (DeltaOpal, Fibermax 966, CD-401, Guazuncho-2, Acala 90 e BRS 286). O DNA genômico total foi extraído de sementes pelo método SDS e amplificado por PCR, usando primers de microsatélites. Os produtos de amplificação foram aplicados em gel de poliacrilamida para avaliação do tamanho dos alelos amplificados. Resultados: C