L'hépatite E est une maladie à transmission oro-fécale qui peut déclencher des hépatites fulminantes, et atteindre un niveau de mortalité de 1 à 4%, voire 20% chez la femme enceinte. L'agent responsable de cette pathologie est le Virus de l'Hépatite E (VHE), seul membre de la famille des Hepeviridae. Les génotypes 1 et 2 sont inféodés uniquement à l'homme et sont responsables d'épidémies dans les pays en développement ; les génotypes 3 et 4, responsables de cas sporadiques, sont inféodés à la fois a l'homme et à l'animal. Ces dernières années, des cas de transmission zoonotique via la consommation de foies de porcs contaminés ont été documentés, notamment à Mayotte et à La Réunion. Aucune étude dans la zone Océan Indien sur les risques de transmission du VHE du porc à l'Homme n'a été conduite à ce jour. L'objectif de notre étude est donc d'investiguer la présence du VHE dans des foies de porcs de Madagascar. Deux cent cinquante foies de porcs ont été prélevés dans 4 abattoirs d'Antananarivo de novembre 2010 à janvier 2011. La détection du virus s'est faite sur broyats de foie via deux méthodes : une méthode de PCR nichée dérivée de Gyarmati et al. (2007 : in J Virol Methods), et une méthode de RT-PCR en temps réel (Jothikumar et al. 2006 : in J Virol Methods). En parallèle, une PCR nichée permettant l'amplification d'un long fragment de 1kb a été mise en place afin de permettre le séquençage et le génotypage des souches de VHE détectées. Trois des 250 foies testés (1.2%) ont été détectés positifs pour le VHE. Le séquençage d'un fragment de 1 kb a révélé que ces trois souches de VHE appartiennent au génotype 3. Ces trois souches, isolées sur des animaux provenant de régions d'élevage différentes (une sur la côte littorale Nord-Ouest, et les 2 autres sur les hauts plateaux), semblent former un sousclade malgache distinct. Cette étude représente la première mise en évidence de la présence et de la circulation active du virus de l'hépatite E dans la zone océan indien. (