Los plátanos y bananos constituyen fuentes primordiales de alimentos para millones de personas en todo el mundo y en Cuba las áreas destinadas a estos cultivos ocupan una superficie de alrededor de 101 000 ha, constituyendo, los de mayor volumen de propagación a través del cultivo in vitro. La mayoría de las plantaciones están conformadas por híbridos ínterespecíficos, que con frecuencia aparecen infectados por Banana streak virus (BSV). Considerando la necesidad del control de la calidad durante los procesos de multiplicación y certificación de vitroplantas, el objetivo de nuestro trabajo consistió en determinar las especies de BSV que están presentes en Cuba mediante metodologías que permitirán el uso de donantes sanos destinados a la micropropagación del cultivo en todo el país. Para ello, se realizaron colectas de muestras sintomáticas o carentes de síntomas de BSV, de variedades pertenecientes a los grupos genómicos AAB, ABB, AAAB, AABB y AAA; en las provincias de Pinar del Río, La Habana, Villa Clara, Cienfuegos, Ciego de Ávila, Granma y Santiago de Cuba. La prevalencia de BSV en las diferentes variedades, se realizó a través de la reacción en cadena de la polimerasa con inmunocaptura y combinación de iniciadores (Multiplex IC-PCR). La utilización de cebadores específicos en la reacción de PCR, permitió la detección de secuencias episomales de las cuatro especies mas importantes de BSV (Goldfinger (BSGFV), Imové (BsImV), Mysore (BSMysV) y Obino l'Ewaï (BSOLV). La especie BSGFV resultó ser la más frecuente y apareció provocando infecciones episomales simples o mixtas con BSOLV y BSImV. Mediante la implementación de estos métodos se logrará el uso de donantes libres de BSV en el sistema nacional de obtención de vitroplantas.