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Optimisation de la cartographie génétique de familles F1 d'hévéa (Hevea brasiliensis) pour la détection de QTLs et le développement de la sélection assistée par marqueurs

Tran D.M.. 2013. Montpellier : UM2, 41 p.. Mémoire de master 2 -- Biologie des plantes et micro-organismes, biotechnologie, bioprocédés. Biologie des plantes.

Ce stage avait pour but de créer les référentiels génétiques nécessaires à la sélection assistée par marqueurs (SAM) chez deux familles biparentales d'hévéa et d'initier la détection de QTLs pour un caractère de croissance. Le génotypage simultané de 380 individus provenant de 2 croisements différents (PB260 x RRIM600 et PB260 x RRIC100) avec 403 marqueurs microsatellites a permis la réalisation de 2 cartes génétiques saturées, la première portant sur 190 individus avec 304 marqueurs (2004 cM), et la seconde sur 380 individus (190 ayant déjà été partiellement génotypés lors d'une précédente étude) et 354 marqueurs (1916 cM). Les trois cartes parentales ont également été générées. Dans tous les cas on observe une bonne colinéarité entre les marqueurs et un positionnement sur la carte conforme aux résultats obtenus antérieurement sur d'autres familles. Le phénotypage de ces familles expérimentées en champ en Afrique de l'ouest a permis la détection d'un QTL lié au diamètre au collet dans le jeune âge pour la famille PB260 x RRIM600, mais aucun QTL pour l'autre famille. Les données de cartographie seront exploitées dans les trois prochaines années pour effectuer la SAM sur ces deux croisements sur des critères de croissance, production précoce, et résistance à une maladie de feuilles causée par le champignon Corynespora cassiicola.

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