Identificação e caracterização de genes órfãos ("no hits") de café (Coffea canephora ), envolvidos na resposta à seca : [n. 311]
Duarte K.E., Gomes Vieira N., Martins P.K., Ribeiro A.P., Da Cunha B.A.D.B., Molinari H.B.C., Kobayashi A.K., Marraccini P., Carvalho Andrade A.. 2013. In : VIII Simpósio de Pesquisa dos Cafés do Brasil, 25 a 28 de novembro de 2013, Salvador, Brasil. s.l. : s.n., 6 p.. Simpósio de Pesquisa dos Cafés do Brasil. 8, 2013-11-25/2013-11-28, Salvador (Brésil).
O café é uma planta perene, sendo considerada uma das commodities agrÃcolas mais importantes do mundo. Por consequencia, visando-se o estabelecimento de ferramentas de auxÃlio para se acelerar o melhoramento genético desta espécie, avanços significativos em genômica do cafeeiro têm ocorrido nos últimos anos. Como exemplo, pode-se citar a recente conclusão do sequenciamento do genoma completo de Coffea canephora, que servirá de referência para utilização em trabalhos avançados de genética molecular, aplicados diretamente ao melhoramento genético desta espécie, tais como o estabelecimento de programas de seleção genômica ampla (SGA) em cafeeiro. Análises recentes de bioinformática dos genomas completos de plantas indicam que cerca de 20-30% do total de genes de cada genoma são inéditos e especÃficos de cada espécie. Ou seja, essas sequencias genicas não apresentam similaridade alguma com as já depositadas nas bases de dados mundiais e são comumente denominadas de "no hits". Conceitos recentes, denominam esses "no hits" como "genes órfãos" e postulam que o surgimento dos mesmos são resultantes de respostas adaptativas especÃficas de cada espécie em função de estresses e condições adversas por essas enfrentadas, durante o processo evolutivo. Nosso trabalho está focado na identificação e caracterização funcional dos genes órfãos de café, por apresentarem alto potencial de inovação e aplicação biotecnológica. O presente estudo apresenta dados obtidos para alguns desses genes orfãos, denominados de CcUnk (Unknown), previamente identificados no genoma de C. canephora e com foco especial à queles CcUnk genes potencialmente envolvidos na resposta à seca.
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- Marraccini Pierre — Dgdrs / Dgdrs