En 1928 se descubre en Panamá una enfermedad de tipo Pudrición del cogollo (PC) y luego, al final de los años 1960, en Colombia aparece un problema similar. Después, durante los diez años siguientes surgen en Brasil, Surinam y Ecuador enfermedades parecidas, que luego de un tiempo variable puede ser muy rápido su avance, como el caso de Colombia, que llegó a la destrucción casi completa de las plantaciones. Durante más de treinta años, se realizaron numerosas investigaciones en entomología, fitopatología, manejo del cultivo, pero hasta el momento no se tiene ninguna solución práctica. En mejoramiento genético se llegó a la difusión de un híbrido interespecífico, lo que se llama OxG (Elaeis oleifera x Elaeis guineensis), pero este híbrido aún presenta algunos problemas. En particular su tasa de extracción es baja, requiere de polinización asistida y abastecimiento del polen y también el precio de compra de los racimos. Esto hace que este híbrido sea muy poco accesible a los pequeños productores. El Cirad ha desarrollado dos ensayos de materiales guineensis (SH-GP9 y SH-GP10) en Palmeras del Ecuador para buscar fuentes de resistencia en siembras nuevas y en lotes de renovación, confirmando que no funcionan cuando se hace en zonas que fueron afectadas por Pudrición del cogollo.