Le projet Biophyto a pour objectif d'implanter et de favoriser la biodiversité fonctionnelle dans des systèmes de cultures pérennes, tels que les vergers de manguiers, en proposant des pratiques innovantes en fracture avec les modes de production actuels. Pour rétablir les équilibres bioécologiques, les traitements insecticides et herbicides ont été supprimés des pratiques culturales, la biodiversité végétale a été favorisée de manière à créer des habitats favorables aux auxiliaires et défavorables au ravageurs (couvertures végétales, bandes fleuries, plantes refuges). 13 producteurs de sites pilotes ont été au coeur de ce projet en s'impliquant dans la conception et la mise en place de nouvelles pratiques agroécologiques, permettant ainsi la confrontation de ces pratiques en milieu réel. Les pratiques agroécologiques ont été suivies pendant près de 3 ans dans les vergers expérimentaux pour assurer la production de données techniques, agronomiques et économiques sur les parcelles. En parallèle, la réaction physiologique du manguier a également fait l'objet d'études en réponse au changement d'irrigation nécessaire au maintien d'une couverture végétale permanente.