Le test toxinique : une méthode de phénotypage pour l'étude de l'interaction Hevea brasiliensis x Corynespora cassiicola
Tran D.M.. 2016. Montpellier : Université de Montpellier, 256 p.. Thèse de doctorat -- Biologie intégrative, diversité et amélioration des plantes (BIDAP).
Hevea brasiliensis est la seule source commerciale du caoutchouc naturel. La maladie CLF (Corynespora Leaf Fall) provoquée par le champignon Corynespora cassiicola est une pathologie foliaire de l'hévéa importante en Asie et en Afrique. Les épidémies sont liées au développement de nouvelles variétés clonales très sensibles. Une méthode conductimétrique de phénotypage de la réponse de l'hévéa aux exsudats de C. cassiicola (filtrats de culture ou toxine purifiée) a été développée et caractérisée. Ce test toxinique, sans contact direct avec le champignon lui-même, peut être mis en oeuvre sans risque sur les plantations. Après application de gouttes d'exsudats sur des folioles détachées d'un génotype d'hévéa, deux mesures de conductivité C1 et C2 sont réalisées avant et après autoclavage, et le pourcentage de fuite d'électrolyte dû au traitement, %FE = 100*C1/C2, est calculé. L'influence de différents facteurs tels que le stade foliaire et la durée d'incubation, a été précisée. Une corrélation positive a été trouvée entre les réponses au test toxinique et à l'inoculation par des conidies du champignon. La pertinence de la correction de C1 par C2 a été analysée. Deux études du test toxinique ont été réalisées pour une série de clones d'hévéa, d'une part en France avec des plantes en pots cultivées en serre, et d'autre part en Côte d'Ivoire, dans les conditions normalement envisagées pour ce test, avec des folioles provenant de jardins à bois de greffe. La répétabilité entre ces deux études est imparfaite mais néanmoins satisfaisante. Le critère %FE est apparu plus sensible et plus précis que la mesure de la surface de nécrose induite (SN). Une variabilité importante de la sensibilité des clones et de l'agressivité des exsudats a été observée, avec l'existence d'interactions. L'analyse du déterminisme génétique de la réponse au test toxinique a été me née par détection de QTL sur deux populations de la famille biparentale d'hévéa PB260 x RRIM600, analysées sur deux sites
Mots-clés : hevea brasiliensis; corynespora cassiicola; test biologique; relation hôte pathogène; locus des caractères quantitatifs; carte génétique; microsatellite; conductimétrie; effecteur moléculaire; phénotype; génotype; technique analytique; france; côte d'ivoire; qtl
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