Testar se e como populações naturais são adaptadas ao seu ambiente local e prever suas respostas em função das alterações futuras do habitat é de importância fundamental diante do cenário de mudanças climáticas. Este é o caso dos cafeeiros, em que o ritmo das alterações climáticas pode ser rápido e drástico para a adaptação das populações. Usando a distribuição geográfica de populações selvagens com habitats contrastantes, o objetivo do presente estudo foi identificar polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) em genes candidatos (GCs) identificados como estando envolvidos na adaptação de populações de Coffea canephora da Uganda ao seu ambiente local. Em particular, modificações que ocorrem próximos e/ou em genes relacionados à tolerância aos estresses abióticos tornam esses GCs alvos, potenciais determinantes adaptativos das plantas em função das mudanças climáticas. Ao identificar os fatores ambientais que impulsionam esses processos, torna-se possível prever a adaptabilidade esperada das populações para o clima local futuro.