Cet article s'intéresse au rôle des pratiques de gestion interorganisationnelles (PGIO) dans le fonctionnement de communautés qui ne parviennent pas à faire aboutir leur innovation. À partir d'une revue de littérature croisant les approches stratégiques réseaux et les approches de gestion de l'innovation, un cadre d'analyse a été conçu pour explorer quatre domaines de gestion des relations interorganisationnelles permettant de résoudre les obstacles fréquemment rencontrés ont été identifiés : l'engagement et le contrôle ; la formation et l'information ; le pilotage du processus d'innovation ; l'allocation des ressources. À partir de six cas d'étude au Burkina Faso, nous montrons d'une part que les PGIO sont nécessaires mais pas suffisantes pour qu'une communauté d'innovation fonctionne mieux et d'autre part que d'autres domaines de gestion des relations interorganisationnelles sont à considérer. Deux types de communautés d'innovation (dispersée ou désagrégée) sont identifiés, pour lesquels le rôle des PGIO pour renforcer leur capacité à innover est discuté.