La crise économique et sanitaire due à la Covid-19 interpelle les trajectoires de reconfiguration des systèmes alimentaires en République du Congo. Elle questionne la capacité des mesures de régulation prises par les pouvoirs publics et des stratégies d'adaptation des acteurs à induire des inflexions dans la gouvernance structurelle du système alimentaire du pays. L'article analyse les stratégies d'adaptation à la crise en mobilisant des données secondaires et des expériences d'accompagnement de politiques publiques agricoles et alimentaires conduites par les auteurs. Au Congo, le secteur alimentaire reste tributaire des importations et repose sur une agriculture vivrière extensive. Pour gérer la pandémie, un confinement général "¿flexible¿" de la population a été appliqué. Les achats de panique, la réduction de la durée d'activité des marchés et la hausse temporaire des prix des produits alimentaires ont révélé les fragilités du secteur, liées à sa dépendance aux marchés internationaux. La crise a cependant confirmé la capacité d'innovation collective du secteur informel. Elle réhabilite la reconnaissance d'une agriculture de proximité, source d'emplois pour des populations vulnérables. Elle interpelle la conception de politiques agricoles et alimentaires futures au regard d'enjeux d'intégration des risques sanitaires, alimentaires et sociaux, dans le contexte du bassin forestier du Congo, qui est exposé à des risques de résurgence de zoonoses existantes et d'arrivée de maladies émergentes.