Eco-épidémiologie des arénavirus à l'interface rongeur-humain au Mozambique
Mapaco L.. 2022. Montpellier : Université de Montpellier, 219 p.. Thèse de doctorat -- Ecologie de la santé.
Les maladies infectieuses émergentes (MIEs) constituent une préoccupation majeure au niveau mondial et plus de 70 % des nouvelles MIEs sont des zoonoses provenant principalement de la faune sauvage. Les MIEs causées par les mammarenaviruses Lassa et Lujo sont responsables de cas mortels de fièvre hémorragique en Afrique occidentale et australe, respectivement. Le réservoir du virus Lujo est encore inconnu tandis que le principal réservoir du virus Lassa est le rongeur Mastomys natalensis largement répandu en Afrique subsaharienne. Plusieurs autres mammarenaviruses considérés comme non pathogènes pour l'homme ont été isolés principalement chez M. natalensis en Afrique australe. Ainsi, M. natalensis est l'une des plus importantes espèces de rongeurs porteurs de zoonoses ou de zoonoses potentielles. De plus, les vies des rongeurs et des hommes sont souvent entremêlées, ce qui augmente l'interaction rongeur/homme ainsi que le risque d'émergence des maladies zoonotiques transmises par les rongeurs. Cette étude vise à évaluer la circulation des mammarenaviruses et à identifier ses déterminants à l'interface homme/rongeur dans le parc national du Limpopo et sa zone tampon au Mozambique, afin d'améliorer notre connaissance du risque potentiel d'émergence de zoonoses transmises par les rongeurs. Pour atteindre notre objectif principal, nous avons étudié l'écologie des rongeurs, puis nous avons détecté et génotypé les Mammarenavirus, nous avons étudiés les facteurs influençant leur circulation chez M. natalensis et enfin nous avons évalué les connaissances, les attitudes et les pratiques humaines vis-à -vis des rongeurs. Nos résultats indiquent que la structure de la communauté des petits mammifères dans notre zone d'étude comprend sept espèces de rongeurs et une musaraigne. M. natalensis était présent dans les quatre habitats contrastés échantillonnés pendant l'étude, cependant, les champs agricoles irrigués constituent l'habitat principal de cette espèce de rongeur. M. natal
Mots-clés : zoonose; maladie infectieuse; épidémiologie; surveillance épidémiologique; relation homme-faune; maladie de l'homme; rongeur; rodentia; arenaviridae; mozambique; mammarenavirus; arenavirus
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