Architecture génétique de la résistance à la fusariose et à la pourriture basale du stipe chez le palmier à huile (Elaeis guineensis Jacq.)
Daval A.. 2023. Montpellier : Institut Agro Montpellier, 153 p.. Thèse de doctorat -- Génétique et amélioration des plantes.
Le palmier à huile est la première source mondiale d'huile végétale pour la consommation humaine et pour l'industrie. Originaire d'Afrique de l'Ouest, il est cultivé majoritairement en Indonésie et en Malaisie. La production et la survie du palmier à huile peuvent être sérieusement impactées par deux maladies prédominantes, la pourriture basale du stipe causée par Ganoderma boninense (G.b.) et la fusariose causée par Fusarium oxysporum f. sp. elaeidis (F.o.E). En vue d'une réduction des pertes de rendement en huile de palme due aux maladies par la sélection de variétés hautement productives et résistantes, j'ai étudié l'architecture génétique de la résistance du palmier à huile à la fusariose et à la pourriture basale du stipe. Une méthode de cartographie de QTL basée sur l'analyse de pedigree a été définie par l'étude d'une population de palmier à huile faisant partie de la population de sélection récurrente réciproque combinant deux groupes hétérotiques A et B (GA et GB). Le degré de résistance à la pourriture basale du stipe de palmiers parentaux a été évalué sur des descendances de plein-frères inoculées en pré-pépinière par G.b. A partir des informations de pedigree, de la valeur génétique prédite par modélisation statistique et des données de génotypage SSR, un algorithme bayésien sous le logiciel FlexQTLTM a déterminé le nombre et la position des QTL les plus probables de résistance à G.b. L'effet du cumul d'allèles favorables aux QTL prédits par les données de pré-pépinière a été évalué dans une population de palmiers observés au champ pour la pourriture basale. Les palmiers ayant plus de 50% d'allèles favorables aux QTL de résistance précoce montraient une probabilité supérieure de survie à la maladie dans l'âge adulte au champ.Des études sur l'architecture génétique de la résistance à la fusariose et à la pourriture basale du stipe ont alors été réalisées selon la méthode définie précédemment en utilisant un génotypage par puce SNP 67K. Deux dispositifs d'
Mots-clés : contrôle de maladies; résistance aux maladies; fusariose du palmier à huile; fusariose; elaeis guineensis; résistance des plantes adultes; pourriture du pied (plante); ganoderma; maladie des plantes; ganoderma boninense
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Thèse
Agents Cirad, auteurs de cette publication :
- Daval Aurélie — Bios / UMR AGAP
