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Analyse phylogénétique et modélisation moléculaire du virus de la maladie de Newcastle : cas de Madagascar avec le génotype XI

Razafindrafara M.S., Randriamamisolonirina N.T., Andriantsimahavandy A.A., Gil P., Servan de Almeida R., Maminiaina O.F.. 2023. In : Actes du colloque des sciences de vie et de l'environnement. Antananarivo : Université d'Antananarivo, p. 322-329. Colloque des sciences de la vie et de l'environnment, 2023-10-09/2023-10-13, Antananarivo (Madagascar).

La lutte contre la maladie de Newcastle constitue un défi majeur pour Madagascar. En effet, elle est à l'origine d'une lourde perte économique pour les éleveurs. L'objectif de cette étude est de consolider les résultats de recherches entreprises pour comprendre l'évolution du virus de la maladie de Newcastle (VMN) génotype XI circulant à Madagascar. De ce fait, une caractérisation moléculaire du VMN isolé à Madagascar a été réalisée. Par ailleurs, une étude in silico des différentes molécules (protéine F, protéine HN, et CMH) impliquées dans l'interaction virus-cellule hôte a été réalisée. À cette fin, des analyses phylogénétiques et une modélisation moléculaire utilisant la bio-informatique ont été adoptées. L'analyse phylogénétique montre que les souches vaccinales actuellement utilisées présentent une distance génétique en moyenne de 23 % par rapport aux souches circulantes du génotype XI. De même, les souches du génotype XI ont une distance génétique de 3 à 7 % entre elles. L'analyse in silico révèle la présence de diverses mutations au niveau de la protéine F et la protéine HN du génotype XI. Ces mutations sont à l'origine de l'échec vaccinal contre le phénomène d'excrétion virale à Madagascar. Ces informations serviront d'outils précieux dans la conception d'un vaccin contre la maladie de Newcastle adapté au contexte local malgache.

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