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The South Green portal: A comprehensive resource for tropical and Mediterranean crop genomics

Guignon V., Hueber Y., Rouard M., Bocs S., Couvin D., De Lamotte F., Droc G., Dufayard J.F., El Hassouni N., Farcy C., Gkanogiannis A., Hamelin C., Larivière D., Martin G., Ortega E., Pitollat B., Pointet S., Ruiz M., Gautier S., Summo M., This D., Ravel S., Larmande P., Monat C., Sabot F., Tando N., Tranchant-Dubreuil C., Sempere G., Dereeper A.. 2016. Current Plant Biology, 7-8 : p. 6-9.

https://doi.org/10.1016/j.cpb.2016.12.002

The South Green Web portal (http://www.southgreen.fr/) provides access to a large panel of public databases, analytical workflows and bioinformatics resources dedicated to the genomics of tropical and Mediterranean crops. The portal contains currently about 20 information systems and tools and targets a broad range of crops such as Banana, Cacao, Cassava, Coconut, Coffee, Grape, Rice and Sugarcane. (Résumé d'auteur)

Mots-clés : amélioration des plantes; génomique; gène; banque de données; saccharum officinarum; vitis vinifera; oryza sativa; cocos nucifera; coffea; manihot esculenta; theobroma cacao; musa; système d'information; bioinformatique; zone tropicale; plante de culture; ressource génétique végétale; ressource végétale; région méditerranéenne

Thématique : Génétique et amélioration des plantes; Documentation et information; Méthodes mathématiques et statistiques

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