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Cette entrée donne accès aux publications déposées dans Agritrop, pour chaque auteur en activité au Cirad.

Gagnevin Lionel

Unité d'affectation : UMR PHIM (Bios)

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150 publications

Large- and small-scale population structure of Xanthomonas oryzae pv. oryzicola, a bacterial pathogen of rice

Sicard A., Carpenter S., Diallo A., Baruah S., Tekete C., Konate L., Keita I., Doucoure H., Nguyen P.D., Le Cao Q., Sarra S., Dembélé M., Tollenaere C., Poulin L., Tall H., Blondin L., Verdier V., Koebnik R., Zougrana S., Raveloson H., Gagnevin L., Onaga G., Cunnac S., Vernière C., Wonni I., Koita O., Szurek B., Bogdanove A.J., Hutin M.. 2025. Applied and Environmental Microbiology, 91 (10) : 16 p..

DOI: 10.1128/aem.01121-25

Article (a-revue à facteur d'impact)

New, complete circularized genomes of Xanthomonas citri pv. mangiferaeindicae produced from short- and long-read co-assembly shed light on strains that emerged a decade ago on mango and cashew in Burkina Faso

Boyer C., Lefeuvre P., Zombre C., Rieux A., Wonni I., Gagnevin L., Pruvost O.. 2025. Phytopathology, 115 (1) : p. 14-19.

DOI: 10.1094/PHYTO-08-24-0267-SC

Article (a-revue à facteur d'impact)

Comparative transcriptomics reveals a highly polymorphic Xanthomonas HrpG virulence regulon

Monnens T.Q., Roux B., Cunnac S., Charbit E., Carrère S., Lauber E., Jardinaud M.F., Darrasse A., Arlat M., Szurek B., Pruvost O., Jacques M.A., Gagnevin L., Koebnik R., Noel L.D., Boulanger A.. 2024. BMC Genomics, 25 : 17 p..

DOI: 10.57745/9OTYNJ

DOI: 10.1186/s12864-024-10684-6

Article (a-revue à facteur d'impact)

Evolutionary and epidemiological insights from historical and modern genomes of Xanthomonas oryzae pv. oryzicola, the causal agent of bacterial leaf streak of rice

Hutin M., Carpenter S., Baruah S., Campos P., Boyer K., Andriantsimialona D., Rapanarivo S.H., Pruvost O., Becker N., Gagnevin L., Koebnik R., Szurek B., Koita O., Bogdanove A.J., Rieux A.. 2024. Molecular Plant-Microbe Interactions, 37 (12) : p. 814-818.

DOI: 10.1094/mpmi-05-24-0062-sc

Article (a-revue à facteur d'impact)

CRISPRi in Xanthomonas demonstrates functional convergence of transcription activator-like effectors in two divergent pathogens

Zárate-Chaves C.A., Audran C., Medina Culma C.A., Escalon A., Javegny S., Gagnevin L., Thomas E., Pimparé L.L., López C.E., Jacobs J.M., Noel L.D., Koebnik R., Bernal A.J., Szurek B.. 2023. New Phytologist, 238 (4) : p. 1593-1604.

DOI: 10.1111/nph.18808

Article (a-revue à facteur d'impact)

Genetic structure and TALome analysis highlight a high level of diversity in burkinabe Xanthomonas Oryzae pv. oryzae populations

Diallo A., Wonni I., Sicard A., Blondin L., Gagnevin L., Vernière C., Szurek B., Hutin M.. 2023. Rice, 16 : 14 p..

DOI: 10.1186/s12284-023-00648-x

Article (a-revue à facteur d'impact)

Herbarium specimen sequencing allows precise dating of Xanthomonas citri pv. citri diversification history

Campos P., Pruvost O., Boyer K., Chiroleu F., Cao T.T., Gaudeul M., Baider C., Utteridge T.M.A., Becker N., Rieux A., Gagnevin L.. 2023. Nature Communications, 14 : 13 p..

DOI: 10.1038/s41467-023-39950-z

Article (a-revue à facteur d'impact)

Crispri as a tool for the functional study of gene families in Xanthomonas

Zárate-Chaves C.A., Audran C., Medina C., Escalon A., Javegny S., Gagnevin L., Thomas E., Pimparé L.L., López C.E., Jacobs J., Noel L.D., Koebnik R., Szurek B., Bernal A.J.. 2023. In : 12th International Congress of Plant Pathology (ICPP 2023): One health for all plants, crops and trees. Book of abstracts. Lyon : ISPP, p. 575-576. International Conference on Plant Pathology (ICPP 2023). 12, 2023-08-20/2023-08-25, Lyon (France).

Communication de congrès

Herbaria in natural history collections illuminate the evolutionary history and emergence of Citrus bacterial canker

Gagnevin L., Campos P.E., Pruvost O., Boyer K., Becker N., Rieux A.. 2023. In : 16th Plant Bacteria Meeting. Abstract Booklet. Aussois : INRAE, p. 83-83. Rencontres plantes-bactéries. 16, 2023-03-20/2023-03-24, Aussois (France).

Communication de congrès

Herbaria in natural history collections illuminate the evolutionary history and emergence of Citrus bacterial canker [F2.3-2]

Gagnevin L., Campos P., Pruvost O., Boyer K., Becker N., Rieux A.. 2023. In : 12th International Congress of Plant Pathology (ICPP 2023): One health for all plants, crops and trees. Book of abstracts. Lyon : ISPP, p. 817. International Conference on Plant Pathology (ICPP 2023). 12, 2023-08-20/2023-08-25, Lyon (France).

Communication de congrès

Exploring the emergence and evolution of plant pathogenic microbes using historical and paleontological sources

Malmstrom C.M., Martin M., Gagnevin L.. 2022. Annual Review of Phytopathology, 60 (1) : p. 187-209.

DOI: 10.1146/annurev-phyto-021021-041830

Article (a-revue à facteur d'impact)

First historical genome of a crop bacterial pathogen from herbarium specimen: Insights into citrus canker emergence

Campos P., Groot Crego C., Boyer K., Gaudeul M., Baider C., Richard D., Pruvost O., Roumagnac P., Szurek B., Becker N., Gagnevin L., Rieux A.. 2021. PLoS Pathogens, 17 (7) : 25 p..

DOI: 10.1371/journal.ppat.1009714

Article (a-revue à facteur d'impact)

Herbaria, a window into the evolutionary history of crop pathogens

Gagnevin L., Rieux A., Lett J.M., Roumagnac P., Szurek B., Campos P., Baider C., Gaudeul M., Becker N.. 2021. In : Pellens Roseli (ed.). Natural history collections in the sciences of the 21st century: A sustainable resource for open science. Londres : ISTE; John Wiley, p. 195-218. (Sciences - Biology: Systematics, Phylogenomic and Taxonomy / ISTE).

DOI: 10.1002/9781119882237.ch13

Chapitre d'ouvrage

Les herbiers, une fenêtre ouverte sur l'histoire évolutive des agents pathogènes des cultures

Gagnevin L., Rieux A., Lett J.M., Roumagnac P., Szurek B., Campos P., Baider C., Gaudeul M., Becker N.. 2021. In : Pellens Roseli (ed.). Les collections naturalistes dans la science du XXIe siècle : une ressource durable pour la science ouverte. Londres : ISTE, p. 197-219. (Sciences - Biologie : Systématique, phylogénomiques et taxonomie / ISTE).

Chapitre d'ouvrage

Development and comparative validation of genomic-driven PCR-based assays to detect Xanthomonas citri pv. citri in citrus plants

Robène I., Maillot-Lebon M.V., Chabirand A., Moreau A., Becker N., Moumène A., Rieux A., Campos P., Gagnevin L., Gaudeul M., Baider C., Chiroleu F., Pruvost O.. 2020. BMC Microbiology, 20 : 13 p..

DOI: 10.1186/s12866-020-01972-8

Article (a-revue à facteur d'impact)

First Report of Xanthomonas phaseoli pv. manihotis, the Causal Agent of Cassava Bacterial Blight, in Mali

Kanté M., Flores C., Moufid Y., Wonni I., Hutin M., Thomas E., Fabre S., Gagnevin L., Dagno K., Verdier V., Koita O., Szurek B.. 2020. Plant Disease, 104 (6) : p. 1852.

DOI: 10.1094/PDIS-12-19-2611-PDN

Article (a-revue à facteur d'impact)

Repeated gain and loss of a single gene modulates the evolution of vascular plant pathogen lifestyles

Gluck-Thaler E., Cerutti A., Pérez-Quintero A.L., Butchacas J., Roman-Reyna V., Madhavan V.N., Shantharaj D., Merfa M.V., Pesce C., Jauneau A., Vancheva T., Lang J.M., Allen C., Verdier V., Gagnevin L., Szurek B., Beckham G.T., De La Fuente L., Patel H.K., Sonti R.V., Bragard C., Leach J.E., Noel L.D., Slot J., Koebnik R., Jacobs J.M.. 2020. Science Advances, 6 (46) : 10 p..

DOI: 10.1126/sciadv.abc4516

Article (a-revue à facteur d'impact)

CRISPR elements provide a new framework for the genealogy of the citrus canker pathogen Xanthomonas citri pv. citri

Jeong K., Muñoz-Bodnar A., Arias Rojas N., Poulin L., Rodríguez-R L.M., Gagnevin L., Vernière C., Pruvost O., Koebnik R.. 2019. BMC Genomics, 20 : 19 p..

DOI: 10.1186/s12864-019-6267-z

Article (a-revue à facteur d'impact)

Development of a duplex-PCR for differential diagnosis of Xanthomonas phaseoli pv. manihotis and Xanthomonas cassavae in cassava (Manihot esculenta)

Flores C., Zarate C., Triplett L.R., Maillot-Lebon M.V., Moufid Y., Kanté M., Bragard C., Verdier V., Gagnevin L., Szurek B., Robène I.. 2019. Physiological and Molecular Plant Pathology, 105 : p. 34-46.

DOI: 10.1016/j.pmpp.2018.07.005

Article (a-revue à facteur d'impact)

Ebb and flow of vascular pathogenesis through repeated gain

Gluck-Thaler E., Cerutti A., Perez Quintero A.L., Pesce C., Jauneau A., Vancheva T., Lang J.M., Allen C., Verdier-Michel V., Gagnevin L., Szurek B., Cunnac S., Bragard C., Leach J.E., Noel L.D., Slot J., Koebnik R., Jacobs J.M.. 2019. Molecular Plant-Microbe Interactions, 32 (10S) : p. S1.22. IS-MPMI Congress. 18, 2019-07-14/2019-07-18, Glasgow (Royaume-Uni).

DOI: 10.1094/MPMI-32-10-S1.1

Article (a-revue à facteur d'impact)

Another night at the museum: searching for traces of plant viruses using the virion-associated nucleic acid metagenomics approach. [P.21]

Julian C., Filloux D., Rieux A., Lefeuvre P., Lett J.M., Becker N., Gagnevin L., Trinder-Smith T.H., Hartnady P., Martin D.P., Roumagnac P.. 2019. In : Livre des résumés des 17 ème Rencontres de virologie végétale. Aussois : INRA, p. 80-80. Rencontres de Virologie Végétale (RVV 2019). 17, 2019-01-27/2019-01-31, Aussois (France).

Communication de congrès

Deciphering the invasive history of a bacterial crop pathogen in the Southern Indian Ocean islands: insights from historical herbarium specimens

Campos P., Groot Crego C., Boyer K., Gaudeul M., Baider C., Pruvost O., Gagnevin L., Becker N., Rieux A.. 2019. In : Flores Olivier (ed.), Ah-Peng Claudine (ed.), Wilding Nicholas (ed.). Book of abstracts posters of the third international conference on Island ecology, evolution and conservation. Saint-Denis : Université de la Réunion, p. 325-325. International conference on Island ecology, evolution and conservation. 3, 2019-07-08/2019-07-13, Saint-Denis (Réunion).

Communication de congrès

Horizontal gene transfer plays a major role in the pathological convergence of Xanthomonas lineages on common bean

Chen N.W.G., Serres-Giardi L., Ruh M., Briand M., Bonneau S., Darrasse A., Barbe V., Gagnevin L., Koebnik R., Jacques M.A.. 2018. BMC Genomics, 19 : 20 p..

DOI: 10.1186/s12864-018-4975-4

Article (a-revue à facteur d'impact)

" Night at the museum ": filling the gaps in the history of emergence of crop pathogenic bacteria using herbarium material

Rieux A., Roumagnac P., Szurek B., Gaudeul M., Becker N., Gagnevin L.. 2018. In : 13èmes Rencontres Plantes-Bactéries - Book of Abstracts. Paris : SFP, p. 18-18. Rencontres Plantes-Bactéries. 13, 2018-01-29/2018-02-02, Aussois (France).

Communication de congrès

The biological and evolutionary basis of systemic plant pathogenesis in Xanthomonas. Session 4. Oral 35

Jacobs J.M., Pesce C., Vancheva T., Lang J.M., Pérez-Quintero A.L., Allen C., Leach J.E., Gagnevin L., Szurek B., Cunnac S., Bragard C., Koebnik R.. 2017. In : Deepen Knowledge in Plant Pathology for Innovative Agro-Ecology. Book of Abstracts of the 12th European Fondation for Plant Pathology (EFPP) and the 10th French Society for Plant Pathology (SFP). Dunkerque : EFPP; FSP, 1 p.. European Foundation for Plant Pathology Conference. 12, 2017-05-29/2017-06-02, Dunkerque (France).

Communication de congrès

Transcription activator like effectors are involved in the host adaptation of Xanthomonas strains responsible for common bacterial blight of bean

Ruh M., Bonneau S., Foucher J., Préveaux A., Gagnevin L., Szurek B., Noel L., Jacques M.A., Chen N.W.G.. 2017. In : FEMS 2017 - 7th Congress of European Microbiologists. Abstract book. Valencia : FEMS, 1 p.. Congress of European Microbiologists (FEMS 2017). 7, 2017-07-09/2017-07-13, Valencia (Espagne).

Communication de congrès

Using ecology, physiology, and genomics to understand host specificity in Xanthomonas

Jacques M.A., Arlat M., Boulanger A., Boureau T., Carrère S., Cesbron S., Chen N.W.G., Cociancich S., Darrasse A., Denancé N., Fischer-Le-Caux M., Gagnevin L., Koebnik R., Lauber E., Noel L.D., Pieretti I., Portier P., Pruvost O., Rieux A., Robène I., Royer M., Szurek B., Verdier V., Vernière C.. 2016. Annual Review of Phytopathology, 54 : p. 163-187.

DOI: 10.1146/annurev-phyto-080615-100147

Article (a-revue à facteur d'impact)

High-quality draft genome sequences of two Xanthomonas pathotype strains infecting aroid plants

Robène I., Bolot S., Pruvost O., Arlat M., Noel L.D., Carrère S., Jacques M.A., Koebnik R., Gagnevin L.. 2016. Genome Announcements, 4 (5) : 2 p..

DOI: 10.1128/genomeA.00902-16

Article (b-revue à comité de lecture)

Comparative genomics of 43 strains of Xanthomonas citri pv. citri reveals the evolutionary events giving rise to pathotypes with different host ranges

Gordon J., Lefeuvre P., Escalon A., Barbe V., Cruveiller S., Gagnevin L., Pruvost O.. 2015. BMC Genomics, 16 (1098) : 20 p..

DOI: 10.5061/dryad.8t53k

DOI: 10.1186/s12864-015-2310-x

Article (a-revue à facteur d'impact)

Genetic structure analysis of strains causing citrus canker in Iran reveals the presence of two different lineages of Xanthomonas citri pv. citri pathotype A*

Pruvost O., Goodarzi T., Boyer K., Soltaninejad H., Escalon A., Alavi S.M., Javegny S., Boyer C., Cottyn B., Gagnevin L., Vernière C.. 2015. Plant Pathology, 64 (4) : p. 776-784.

DOI: 10.1111/ppa.12324

Article (a-revue à facteur d'impact)

Genomics and transcriptomics of Xanthomonas campestris species challenge the concept of core type III effectome

Roux B., Bolot S., Guy E., Denancé N., Lautier M., Jardinaud M.F., Fischer-Le-Caux M., Portier P., Jacques M.A., Gagnevin L., Pruvost O., Lauber E., Arlat M., Carrère S., Koebnik R., Noel L.D.. 2015. BMC Genomics, 16 (975) : 19 p..

DOI: 10.1186/s12864-015-2190-0

Article (a-revue à facteur d'impact)

New multilocus variable-number tandem-repeat analysis tool for surveillance and local epidemiology of bacterial leaf blight and bacterial leaf streak of rice caused by Xanthomonas oryzae

Poulin L., Grygiel P., Magne M., Gagnevin L., Rodríguez-R L.M., Forero Serna N., Zhao S., El Rafil M., Dao S., Tekete C., Wonni I., Kolta O., Pruvost O., Verdier V., Vernière C., Koebnik R.. 2015. Applied and Environmental Microbiology, 81 (2) : p. 688-698.

DOI: 10.1128/AEM.02768-14

Article (a-revue à facteur d'impact)

QueTAL: A suite of tools to classify and compare TAL effectors functionally and phylogenetically

Pérez-Quintero A.L., Lamy L., Gordon J., Escalon A., Cunnac S., Szurek B., Gagnevin L.. 2015. Frontiers in Plant Science, 6 (545) : 16 p..

DOI: 10.3389/fpls.2015.00545

Article (a-revue à facteur d'impact)

Draft Genome Sequence of Xanthomonas translucens pv. graminis Pathotype Strain CFBP 2053

Pesce C., Bolot S., Berthelot E., Bragard C., Cunnac S., Fischer-Le Saux M., Portier P., Arlat M., Gagnevin L., Jacques M.A., Noel L.D., Carrère S., Koebnik R.. 2015. Genome Announcements, 3 (5) : 15 p..

DOI: 10.1128/genomeA.01174-15

Article (b-revue à comité de lecture)

High-Quality Draft Genome Sequence of the Xanthomonas translucens pv. cerealis Pathotype Strain CFBP 2541

Pesce C., Bolot S., Cunnac S., Portier P., Fischer-Le-Caux M., Jacques M.A., Gagnevin L., Arlat M., Noel L.D., Carrère S., Bragard C., Koebnik R.. 2015. Genome Announcements, 3 (1) : 2 p..

DOI: 10.1128/genomeA.01574-14

Article (b-revue à comité de lecture)

The dynamic world of the genus Xanthomonas

Pruvost O., Robène I., Escalon A., Leduc A., Gagnevin L., Vernière C., Wang N., Schwartz H.F., Gent D.H., Rott P., Royer M., Alvarez A.M., Vowell T.S., Toves P.J., White F.F., Potnis N., Jones J.B.. 2015. In : Wang Nian (ed.), Jones Jeffrey B. (ed.), Sundin George W. (ed.), White Frank F. (ed.), Hogenhout Saskia A. (ed.), Roper Caroline (ed.), De La Fuente Leonardo (ed.), Ham Jong Hyun (ed.). Virulence mechanisms of plant pathogenic bacteria. Saint Paul : The American Phytopathological Society, p. 381-385.

Chapitre d'ouvrage

Tandem repeats as genotyping tools for understanding the genetic structure and epidemiology of Xanthomonas citri pv. citri

Leduc A., Traoré Y.N., Boyer K., Magne M., Grygiel P., Gordon J., Boyer C., Guérin F., Wonni I., Ouédraogo L., Koebnik R., Verdier V., Gagnevin L., Vernière C., Ravigné V., Pruvost O.. 2015. In : Xanthomonas Genomics Conference 2015 Book of Abstracts. Bogota : Universidad de los Andes, p. 22-22. Xanthomonas Genomics Conference 2015, 2015-07-08/2015-07-11, Bogota (Colombie).

Communication de congrès

A MLVA genotyping scheme for global surveillance of the citrus pathogen Xanthomonas citri pv. citri suggests a worldwide geographical expansion of a single genetic lineage

Pruvost O., Magne M., Boyer K., Leduc A., Tourterel C., Drevet C., Ravigné V., Gagnevin L., Guérin F., Chiroleu F., Koebnik R., Verdier V., Vernière C.. 2014. PloS One, 9 (6) : 11 p..

DOI: 10.1371/journal.pone.0098129

Article (a-revue à facteur d'impact)

First report of Xanthomonas citri pv. mangiferaeindicae causing mango bacterial canker on Mangifera indica in Ivory Coast

Pruvost O., Boyer C., Grygiel P., Boyer K., Vernière C., Gagnevin L., Soro S., N'Guessan C.A., Koné D.. 2014. Plant Disease, 98 (12) : p. 1740-1740.

DOI: 10.1094/PDIS-07-14-0669-PDN

Article (a-revue à facteur d'impact)

Highly polymorphic markers reveal the establishment of an invasive lineage of the citrus bacterial pathogen Xanthomonas citri pv. citri in its area of origin

Vernière C., Bui Thi Ngoc L., Jarne P., Ravigné V., Guérin F., Gagnevin L., Le Mai N., Chau N.M., Pruvost O.. 2014. Environmental Microbiology, 16 (7) : p. 2226-2237.

DOI: 10.1111/1462-2920.12369

Article (a-revue à facteur d'impact)

Draft genome sequence of the flagellated Xanthomonas fuscans subsp. fuscans strain CFBP 4884

Indiana A., Briand M., Arlat M., Gagnevin L., Koebnik R., Noel L.D., Portier P., Darrasse A., Jacques M.A.. 2014. Genome Announcements, 2 (5) : 2 p..

DOI: 10.1128/genomeA.00966-14

Article (b-revue à comité de lecture)

Draft genome sequence of Xanthomonas axonopodis pv. allii strain CFBP 6369

Gagnevin L., Bolot S., Gordon J., Pruvost O., Vernière C., Robène I., Arlat M., Noel L.D., Carrère S., Jacques M.A., Koebnik R.. 2014. Genome Announcements, 2 (4) : 2 p..

DOI: 10.1128/genomeA.00727-14

Article (b-revue à comité de lecture)

A MLVA genotyping scheme for global surveillance of the citrus pathogen Xanthomonas citri pv. citri suggests a worldwide geographical expansion of a single genetic lineage. [S4-O6]

Pruvost O., Magne M., Boyer K., Leduc A., Tourterel C., Drevet C., Ravigné V., Gagnevin L., Guérin F., Chiroleu F., Koebnik R., Verdier V., Vernière C.. 2014. In : The 13th International Conference on Plant Pathogenic Bacteria. Programme and abstracts. Shanghai : SCPBD, p. 94-95. 13th International Conference on Plant Pathogenic Bacteria, 2014-06-08/2014-06-13, Shanghai (Chine).

Communication de congrès

A VNTR tool for diagnostic and epidemiological surveillance of the plant pathogen Xanthomonas oryzae and its application to the newly reported Malagasy BLS epidemics : Session 5- Dynamique, épidémiologie et génétique des populations bactériennes

Poulin L., Grygiel P., Magne M., Gagnevin L., Vernière C., Rodríguez-R L.M., Forero Serna N., Zhao S., Rafii M., Verdier V., Koebnik R.. 2014. In : SFP ; INRA ; CNRS ; IRD ; CIRAD. 11èmes Rencontres Plantes-Bactéries, Aussois, France, 3-7 février 2014. Paris : SFP, p. 61-61. Rencontres plantes-bactéries. 11, 2014-02-03/2014-02-07, Aussois (France).

Communication de congrès

Comparative genomics and transcriptomics of Xanthomonas campestris : Session 3- Physiologie, génétique et génomique des bactéries

Bolot S., Roux B., Guy E., Denancé N., Lautier M., Lauber E., Jardinaud M.F., Koebnik R., Gagnevin L., Poussier S., Carrère S., Arlat M., Noel L.D.. 2014. In : SFP ; INRA ; CNRS ; IRD ; CIRAD. 11èmes Rencontres Plantes-Bactéries, Aussois, France, 3-7 février 2014. Paris : SFP, p. 40-40. Rencontres plantes-bactéries. 11, 2014-02-03/2014-02-07, Aussois (France).

Communication de congrès

Developpment of a new multilocus Variable-Number Tandem Repeat typing scheme for the global surveillance of Xanthomonas citri pv. Citri : Poster 19

Pruvost O., Magne M., Vital K., Leduc A., Tourterel C., Ravigné V., Gagnevin L., Guérin F., Vernière C.. 2014. In : SFP ; INRA ; CNRS ; IRD ; CIRAD. 11èmes Rencontres Plantes-Bactéries, Aussois, France, 3-7 février 2014. Paris : SFP, p. 97-97. Rencontres plantes-bactéries. 11, 2014-02-03/2014-02-07, Aussois (France).

Communication de congrès

Recherche de déterminants de la spécificité d'hôte chez X. axonopodis pv. Phaseoli : Session 2- Evolution et plasticité des génomes bactériens

Serres-Giardi L., Chen N.W.G., Briand M., Darrasse A., Gagnevin L., Koebnik R., Noel L.D., Jacques M.A.. 2014. In : SFP ; INRA ; CNRS ; IRD ; CIRAD. 11èmes Rencontres Plantes-Bactéries, Aussois, France, 3-7 février 2014. Paris : SFP, p. 29-29. Rencontres plantes-bactéries. 11, 2014-02-03/2014-02-07, Aussois (France).

Communication de congrès

Variation in the TAL arsenal of Xanthomonas citri pv. Citri pathotypic specificity : Session 3- Physiologie, génétique et génomique des bactéries

Escalon A., Guardini L., Javegny S., Szurek B., Pérez-Quintero A.L., Lefeuvre P., Vernière C., Pruvost O., Noel L.D., Arlat M., Gagnevin L.. 2014. In : SFP ; INRA ; CNRS ; IRD ; CIRAD. 11èmes Rencontres Plantes-Bactéries, Aussois, France, 3-7 février 2014. Paris : SFP, p. 44-44. Rencontres plantes-bactéries. 11, 2014-02-03/2014-02-07, Aussois (France).

Communication de congrès

CRISPR systems in plant pathogens: A new tool for epidemiological surveillance

Jeong K., Munoz Bodnar A., Poulin L., Arias Rojas N., Rodríguez-R L.M., Gagnevin L., Pruvost O., Koebnik R.. 2013. Phytopathology, 103 (6) : p. S2.67-S2.68. APS-MSA Conference, 2013-08-10/2013-08-14, Austin (Etats-Unis).

Article (a-revue à facteur d'impact)

Genome and transcriptome analysis to reveal adaptation to new environments and hosts

Gagnevin L., Roux B., Bolot S., Carrère S., Charbit E., Cunnac S., Jacques M.A., Noel L.D., Arlat M., Koebnik R.. 2013. Phytopathology, 103 (6) : p. S2.170-S2.171. APS-MSA Conference, 2013-08-10/2013-08-14, Austin (Etats-Unis).

DOI: 10.1094/PHYTO-103-6-S2.170

Article (a-revue à facteur d'impact)

Genome sequence of Xanthomonas fuscans subsp. fuscans strain 4834-R reveals that flagellar motility is not a general feature of xanthomonads

Darrasse A., Carrère S., Barbe V., Boureau T., Arrieta-Ortiz M.L., Bonneau S., Briand M., Brin C., Cociancich S., Durand K., Fouteau S., Gagnevin L., Guérin F., Guy E., Indiana A., Koebnik R., Lauber E., Munoz A., Noel L.D., Pieretti I., Poussier S., Pruvost O., Robène-Soustrade I., Rott P., Royer M., Serres-Giardi L., Szurek B., Van Sluys M.A., Verdier V., Vernière C., Arlat M., Manceau C., Jacques M.A.. 2013. BMC Genomics, 14 (761) : 30 p..

DOI: 10.1186/1471-2164-14-761

Article (a-revue à facteur d'impact)

Genomic survey of pathogenicity determinants and VNTR markers in the cassava bacterial pathogen Xanthomonas axonopodis pv. manihotis strain CIO151

Arrieta-Ortiz M.L., Rodríguez-R L.M., Pérez-Quintero A.L., Poulin L., Díaz A.C., Arias Rojas N., Trujillo C., Restrepo Benavides M., Bart R., Boch J., Boureau T., Darrasse A., David P., Dugé de Bernonville T., Fontanilla P., Gagnevin L., Guérin F., Jacques M.A., Lauber E., Lefeuvre P., Medina C., Medina E., Montenegro N., Munoz A., Noel L.D., Ortiz Quiñoes J.F., Osorio D., Pardo C., Patil P.B., Poussier S., Pruvost O., Robène-Soustrade I., Ryan R.P., Tabima J., Urrego Morales O.G., Vernière C., Carrère S., Verdier V., Szurek B., Restrepo S., López C.E., Koebnik R., Bernal A.J.. 2013. PloS One, 8 (11) : 18 p..

DOI: 10.1371/journal.pone.0079704

Article (a-revue à facteur d'impact)

Variations in type III effector repertoires, pathological phenotypes and host range of Xanthomonas citri pv. citri pathotypes

Escalon A., Javegny S., Vernière C., Noel L.D., Vital K., Poussier S., Hajri A., Boureau T., Pruvost O., Arlat M., Gagnevin L.. 2013. Molecular Plant Pathology, 14 (5) : p. 483-496.

DOI: 10.1111/mpp.12019

Article (a-revue à facteur d'impact)

Draft genome sequence of the Xanthomonas cassavae type strain CFBP 4642

Bolot S., Munoz Bodnar A., Cunnac S., Ortiz E., Szurek B., Noel L.D., Arlat M., Jacques M.A., Gagnevin L., Portier P., Fischer-Le Saux M., Carrère S., Koebnik R.. 2013. Genome Announcements, 1 (4) : 13 p..

DOI: 10.1128/genomeA.00679-13

Article (b-revue à comité de lecture)

High-quality draft genome sequence of Xanthomonas alfalfae subsp. alfalfae strain CFBP 3836

Jacques M.A., Bolot S., Charbit E., Darrasse A., Briand M., Arlat M., Gagnevin L., Koebnik R., Noel L.D., Portier P., Carrère S., Boureau T.. 2013. Genome Announcements, 1 (6) : 2 p..

DOI: 10.1128/genomeA.01035-13

Article (b-revue à comité de lecture)

High-Quality Draft Genome Sequences of Two Xanthomonas citri pv. malvacearum Strains

Cunnac S., Bolot S., Forero Serna N., Ortiz E., Szurek B., Noel L.D., Arlat M., Jacques M.A., Gagnevin L., Carrère S., Nicole M., Koebnik R.. 2013. Genome Announcements, 1 (4) : 2 p..

DOI: 10.1128/genomeA.00674-13

Article (b-revue à comité de lecture)

High-quality draft genome sequences of Xanthomonas axonopodis pv. glycines strains CFBP 2526 and CFBP 7119

Darrasse A., Bolot S., Serres-Giardi L., Charbit E., Boureau T., Fisher-Le Saux M., Briand M., Arlat M., Gagnevin L., Koebnik R., Noel L.D., Carrère S., Jacques M.A.. 2013. Genome Announcements, 1 (6) : 2 p..

DOI: 10.1128/genomeA.01036-13

Article (b-revue à comité de lecture)

First report in Mali of Xanthomonas citri pv. mangiferaeindicae causing mango bacterial canker on Mangifera indica L.

Pruvost O., Boyer C., Vital K., Vernière C., Gagnevin L., Traoré Y.N.. 2012. Plant Disease, 96 (4) : p. 581-581.

DOI: 10.1094/PDIS-01-12-0001-PDN

Article (a-revue à facteur d'impact)

MultiLocus Sequence Analysis- and Amplified Fragment Length Polymorphism-based characterization of xanthomonads associated with bacterial spot of tomato and pepper and their relatedness to Xanthomonas species

Hamza A.A., Robène-Soustrade I., Jouen E., Lefeuvre P., Chiroleu F., Fisher-Le Saux M., Gagnevin L., Pruvost O.. 2012. Systematic and Applied Microbiology, 35 (3) : p. 183-190.

DOI: 10.1016/j.syapm.2011.12.005

Article (a-revue à facteur d'impact)

4th Xanthomonas genomics conference, Angers, France, july 9-12, 2012 : Book of abstracts

Manceau C. (ed.), Jacques M.A. (ed.), Arlat M. (ed.), Lauber E. (ed.), Noel L.D. (ed.), Gagnevin L. (ed.), Pruvost O. (ed.), Rott P. (ed.), Royer M. (ed.), Koebnik R. (ed.), Verdier V. (ed.). 2012. Paris : INRA, 85 p.. Xanthomonas genomics conference 2012. 4, 2012-07-09/2012-07-12, Angers (France).

Actes de congrès

A new minisatellite-based scheme for the global surveillance of Xanthomonas citri pv. citri, the causal agent of Asiatic Citrus Canker. : S12O12

Magne M., Leduc A., Vernière C., Vital K., Gordon J., Escalon A., Guérin F., Gagnevin L., Pruvost O.. 2012. In : Navarro Luis (ed.). XII International Citrus Congress : Book of abstract. Riverside : ISC, p. 197-198. International Citrus congress "Citrus and health. 12, 2012-11-18/2012-11-23, Valence (Espagne).

Communication de congrès

Genome sequencing of Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli CFBP4834-R reveals that flagellar motility is not a general feature of xanthomonads.

Darrasse A., Carrère S., Barbe V., Bourreau T., Bernal A.J., Bonneau S., Brin C., Cociancich S., Durand K., Fouteau S., Gagnevin L., Gouzy J., Guérin F., Guy E., Indiana A., Koebnik R., Lauber E., Munoz A., Noel L.D., Pieretti I., Poussier S., Pruvost O., Robène-Soustrade I., Rott P., Royer M., Szurek B., Van Sluys M.A., Verdier V., Vernière C., Arlat M., Manceau C., Jacques M.A.. 2012. In : Manceau Charles (ed.), Jacques Marie Agnès (ed.), Arlat Mathieu (ed.), Lauber Emmanuelle (ed.), Noel Laurent D. (ed.), Gagnevin Lionel (ed.), Pruvost Olivier (ed.), Rott Philippe (ed.), Royer Monique (ed.), Koebnik Ralf (ed.), Verdier Valérie (ed.). 4th Xanthomonas genomics conference, Angers, France, july 9-12, 2012 : Book of abstracts. Paris : INRA, p. 13-13. Xanthomonas genomics conference 2012. 4, 2012-07-09/2012-07-12, Angers (France).

Communication de congrès

Répertoires d'effecteurs de type III, phylogénie et pouvoir pathogène chez X. c.pv.citri

Escalon A., Javegny S., Vital K., Boyer C., Vernière C., Pruvost O., Gagnevin L.. 2012. In : INRA ; SFP ; IRD. 10èmes Rencontres plantes-bactéries, Aussois, France, 30 janvier-03 février 2012. s.l. : s.n., p. 34-34. Rencontres plantes-bactéries. 10, 2012-01-30/2012-02-03, Aussois (France).

Communication de congrès

Variation in type 3 effector repertoires, pathological phenotypes and host range of Xanthomonas citri pv. citri pathotypes

Escalon A., Javegny S., Vernière C., Noel L.D., Vital K., Poussier S., Hajri A., Boureau T., Pruvost O., Arlat M., Gagnevin L.. 2012. In : IS-MPMI. 15th International Congress of Molecular Plante-Microbe Interactions, July 29 - August 2, 2012, Kyoto, Japan. s.l. : s.n., 1 p.. International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions. 15, 2012-07-29/2012-08-02, Kyoto (Japon).

Communication de congrès

Variations in type III effector repertoires do not correlate with differences in pathological phenotypes and host range observed for Xanthomonas citri pv. citri pathotypes

Escalon A., Javegny S., Vital K., Vernière C., Noel L.D., Pruvost O., Arlat M., Gagnevin L.. 2012. In : IS-MPMI 2012 XV International Congress, program and abstracts, July 29 (Sun.) - August 2 (Thu), 2012. Kyoto, Japan. Saint-Paul : IS-MPMI, p. 278-279. International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions. 15, 2012-07-29/2012-08-02, Kyoto (Japon).

Communication de congrès

First report in Burkina Faso of Xanthomonas citri pv. mangiferaeindicae causing bacterial canker on Mangifera indica

Pruvost O., Boyer C., Vital K., Vernière C., Gagnevin L., Somda I.. 2011. Plant Disease, 95 (10) : p. 1312-1313.

DOI: 10.1094/PDIS-04-11-0324

Article (a-revue à facteur d'impact)

First report in Ghana of Xanthomonas citri pv. mangiferaeindicae causing mango bacterial canker on Mangifera indica

Pruvost O., Boyer C., Vital K., Gagnevin L., De Bruno Austin L., Rey J.Y.. 2011. Plant Disease, 95 (6) : p. 774-774.

DOI: 10.1094/PDIS-02-11-0098

Article (a-revue à facteur d'impact)

Insertion sequence-and tandem repeat-base genotyping techniques for Xanthomonas citri pv. mangiferaeindicae

Pruvost O., Vernière C., Vital K., Guérin F., Jouen E., Chiroleu F., Ah-You N., Gagnevin L.. 2011. Phytopathology, 101 (7) : p. 887-893.

DOI: 10.1094/PHYTO-11-10-0304

Article (a-revue à facteur d'impact)

Amplified fragment length polymorphism and multilocus sequence analysis-based genotypic relatedness among pathogenic variants of Xanthomonas citri pv. citri and Xanthomonas campestris pv. bilvae

Bui Thi Ngoc L., Vernière C., Jouen E., Ah-You N., Lefeuvre P., Chiroleu F., Gagnevin L., Pruvost O.. 2010. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 60 (3) : p. 515-525.

DOI: 10.1099/ijs.0.009514-0

Article (a-revue à facteur d'impact)

Genetic and pathological diversity among Xanthomonas strains responsible for bacterial spot on tomato and pepper in the Southwest Indian Ocean Region

Hamza A.A., Robène-Soustrade I., Jouen E., Gagnevin L., Lefeuvre P., Chiroleu F., Pruvost O.. 2010. Plant Disease, 94 (8) : p. 993-999.

DOI: 10.1094/PDIS-94-8-0993

Article (a-revue à facteur d'impact)

Multiplex nested PCR for detection of Xanthomonas axonopodis pv. allii from onion seeds

Robène-Soustrade I., Legrand D., Gagnevin L., Chiroleu F., Laurent A., Pruvost O.. 2010. Applied and Environmental Microbiology, 76 (9) : p. 2697-2703.

DOI: 10.1128/AEM.02697-09

Article (a-revue à facteur d'impact)

Pseudomonas aeruginosa outbreak linked to mineral water bottles in a neonatal intensive unit: Fast typing by use of high-resolution melting analysis of a variable-number tandem-repeat locus

Naze F., Jouen E., Randriamahazo R.T., Simac C., Laurent P., Blériot A., Chiroleu F., Gagnevin L., Pruvost O., Michault A.. 2010. Journal of Clinical Microbiology, 48 (9) : p. 3146-3152.

DOI: 10.1128/JCM.00402-10

Article (a-revue à facteur d'impact)

Le dépérissement bactérien des Alliacées : émergence d'une phytobactériose

Roumagnac P., Robène-Soustrade I., Humeau L., Gagnevin L., Chiroleu F., Jeuffrault E., Pruvost O.. 2010. In : Barnouin Jacques (ed.), Sache Ivan (ed.). Les maladies émergentes : épidémiologie chez le végétal, l'animal et l'homme. Versailles : Ed. Quae, p. 211-220. (Synthèses).

Chapitre d'ouvrage

Collaboration for diagnosis of Xanthomonas citri pv. mangiferaeindicae causing mango bacterial canker on Mangifera indica in Myanmar : [P2-10]

Myint N.T., Gagnevin L., Pruvost O., Johnson G.I.. 2010. In : Proceedings of the 12th International Conference on Plant Pathogenic Bacteria : programme, abstracts, list of participants. s.l. : s.n., p. 49-49. International Conference on Plant Pathogenic Bacteria. 12, 2010-06-07/2010-06-11, Saint-Denis (Réunion).

Communication de congrès

Genetic and pathological diversity among Xanthomonas strains responsible for bacterial spot on tomato and pepper in the South West Indian Ocean region : [P4-94]

Hamza A.A., Robène-Soustrade I., Jouen E., Gagnevin L., Lefeuvre P., Chiroleu F., Boyer C., Pruvost O.. 2010. In : Proceedings of the 12th International Conference on Plant Pathogenic Bacteria : programme, abstracts, list of participants. s.l. : s.n., p. 160-160. International Conference on Plant Pathogenic Bacteria. 12, 2010-06-07/2010-06-11, Saint-Denis (Réunion).

Communication de congrès

Host range and population structure of Xanthomonas citri pv. mangiferaeindicae : [P4-55]

Gagnevin L., Guérin F., Vital K., Deloison G., Pruvost O.. 2010. In : Proceedings of the 12th International Conference on Plant Pathogenic Bacteria : programme, abstracts, list of participants. s.l. : s.n., p. 121-121. International Conference on Plant Pathogenic Bacteria. 12, 2010-06-07/2010-06-11, Saint-Denis (Réunion).

Communication de congrès

Population structure and molecular epidemiology of Xanthomonas citri pv. citri refine citrus canker epidemiology : [O4-34, Abstract]

Vernière C., Bui Thi Ngoc L., Gagnevin L., Guérin F., Belasque J., Pruvost O.. 2010. In : Proceedings of the 12th International Conference on Plant Pathogenic Bacteria : programme, abstracts, list of participants. s.l. : s.n., p. 108-108. International Conference on Plant Pathogenic Bacteria. 12, 2010-06-07/2010-06-11, Saint-Denis (Réunion).

Communication de congrès

Structure des populations et définition de la gamme d'hôte chez Xanthomonas citri pv. mangiferaeindicae : [N° 12]

Gagnevin L., Guérin F., Vital K., Palloix A., Pruvost O.. 2010. In : Neuvièmes Rencontres plantes-bactéries, 18-22 janvier 2010, Aussois (France) : résumés. Paris : SFP, p. 78-78. Rencontres plantes-bactéries. 9, 2010-01-18/2010-01-22, Aussois (France).

Communication de congrès

Validation of a nested PCR assay for detection of Xanthomonas axonopodis pv. dieffenbachiae in anthurium tissue in a European multicenter collaborative trial : [P2-11]

Jouen E., Chabirand A., Robène-Soustrade I., Gagnevin L., Chiroleu F., Saison A., Boyer C., Cassam N., Laurent A., Hostachy B., Bergsma-Vlami M., Bianchi G., Cozzoli L., Cudejkova M., Elphinstone J., Holeva M.C., Manole F., Martini P., Minatchy J., Op de Beeck G., Sigillo L., Siverio de la Rosa F., Soubelet H., Van Vaerenbergh J., Pruvost O.. 2010. In : Proceedings of the 12th International Conference on Plant Pathogenic Bacteria : programme, abstracts, list of participants. s.l. : s.n., p. 50-50. International Conference on Plant Pathogenic Bacteria. 12, 2010-06-07/2010-06-11, Saint-Denis (Réunion).

Communication de congrès

A new semi-selective medium for isolation of Xanthomonas axonopodis pv. dieffenbachiae, the etiological agent of anthurium bacterial blight

Laurent P., Chabirand A., Jouen E., Robène-Soustrade I., Gagnevin L., Hostachy B., Pruvost O.. 2009. Letters in Applied Microbiology, 49 (2) : p. 210-216.

DOI: 10.1111/j.1472-765X.2009.02643.x

Article (a-revue à facteur d'impact)

Development of 14 minisatellite markers for the citrus canker bacterium, Xanthomonas citri pv. citri

Bui Thi Ngoc L., Vernière C., Vital K., Guérin F., Gagnevin L., Brisse S., Ah-You N., Pruvost O.. 2009. Molecular Ecology Resources, 9 (1) : p. 125-127.

DOI: 10.1111/j.1755-0998.2008.02242.x

Article (a-revue à facteur d'impact)

From local surveys to global surveillance : Three high-throughput genotyping methods for epidemiological monitoring of Xanthomonas citri pv. citri pathotypes

Bui Thi Ngoc L., Vernière C., Jarne P., Brisse S., Guérin F., Boutry S., Gagnevin L., Pruvost O.. 2009. Applied and Environmental Microbiology, 75 (4) : p. 1173-1184.

DOI: 10.1128/AEM.02245-08

Article (a-revue à facteur d'impact)

Polyphasic characterization of xanthomonads pathogenic to members of the Anacardiaceae and their relatedness to species of Xanthomonas

Ah-You N., Gagnevin L., Grimont P.A.D., Brisse S., Nesme X., Chiroleu F., Bui Thi Ngoc L., Jouen E., Lefeuvre P., Vernière C., Pruvost O.. 2009. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 59 (2) : p. 306-318.

DOI: 10.1099/ijs.0.65453-0

Article (a-revue à facteur d'impact)

Populations of Xanthomonas citri pv mangiferaeindicae from asymptomatic mango leaves are primarily endophytic

Pruvost O., Savelon C., Boyer C., Chiroleu F., Gagnevin L., Jacques M.A.. 2009. Microbial Ecology, 58 (1) : p. 170-178.

DOI: 10.1007/s00248-008-9480-x

Article (a-revue à facteur d'impact)

The new IS1595 family, its relation to IS1 and the frontier between insertion sequences and transposons

Siguier P., Gagnevin L., Chandler M.. 2009. Research in Microbiology, 160 (3) : p. 232-241.

DOI: 10.1016/j.resmic.2009.02.003

Article (a-revue à facteur d'impact)

Etablissement récent d'une nouvelle population de Xanthomonas citri pv. citri au sein d'une population endémique au Vietnam

Vernière C., Bui Thi Ngoc L., Pruvost O., Gagnevin L., Guérin F., Jarne P.. 2009. In : Phytopathologie 2009. 7ème Colloque National de la Société Française de Phytopathologie, 8 au 11 Juin 2009, Lyon, France : livre des résumés. Paris : SFP, p. 37-37. Colloque National de la Société Française de Phytopathologie. 7, 2009-06-08/2009-06-11, Lyon (France).

Communication de congrès

New powerful tools for epidemiological analyses of Xanthomonas citri pv. citri with a strong evolutionary aftertaste

Gagnevin L., Bui Thi Ngoc L., Vernière C., Pruvost O.. 2009. In : Xanthomonas Genomics Conference 2009, Pingree Park, USA, July 13-15 2009. s.l. : s.n., 1 p.. Xanthomonas Genomics Conference 2009, 2009-07-13/2009-07-15, Pingree Park (Etats-Unis).

Communication de congrès

A minisatellite-based MLVA scheme for typing Xanthomonas citri pv.mangiferaeindicae

Pruvost O., Vital K., Ah-You N., Vernière C., Chiroleu F., Gagnevin L.. 2008. Journal of Plant Pathology, 90 (2) : S2.362. International Congress of Plant Pathology. 9, 2008-08-24/2008-08-29, Turin (Italie).

Article (a-revue à facteur d'impact)

First report in Mauritius of bacterial leaf blight of Syngonium caused by Xanthomonas campestris pv. syngonii

Jouen E., Robène-Soustrade I., Gagnevin L., Pruvost O., Benimadhu S.. 2008. Plant Disease, 92 (6) : p. 980-980.

DOI: 10.1094/PDIS-92-6-0980A

Article (a-revue à facteur d'impact)

First report of bacterial blight of Anthurium andreanum in Poland

Pulawska J., Kordyla-Bronka M., Jouen E., Robène-Soustrade I., Gagnevin L., Pruvost O., Sobiczewski P., Orlikowski L.. 2008. Plant Pathology, 57 (4) : p. 775-775.

DOI: 10.1111/j.1365-3059.2008.01878.x

Article (a-revue à facteur d'impact)

Ligation-mediated PCR, a fast and reliable technique for insertion sequence-based typing of Xanthomonas citri pv. citri

Bui Thi Ngoc L., Vernière C., Belasque J., Vital K., Boutry S., Gagnevin L., Pruvost O.. 2008. FEMS Microbiology Letters, 288 (1) : p. 33-39.

DOI: 10.1111/j.1574-6968.2008.01331.x

Article (a-revue à facteur d'impact)

Polyphasic characterization of Xanthomonas axonopodis pv. allii associated with outbreaks of bacterial blight on three allium species in the Mascarene Archipelago

Picard Y., Roumagnac P., Legrand D., Humeau L., Robène-Soustrade I., Chiroleu F., Gagnevin L., Pruvost O.. 2008. Phytopathology, 98 (8) : p. 919-925.

DOI: 10.1094/PHYTO-98-8-0919

Article (a-revue à facteur d'impact)

Real-time PCR for detection and quantification of Xanthomonas axonopodis pv. dieffenbachiae on Anthurium

Péréfarres F., Jouen E., Soustrade I., Gagnevin L., Laurent A., Pruvost O.. 2008. Journal of Plant Pathology, 90 (2) : S2.306. International Congress of Plant Pathology. 9, 2008-08-24/2008-08-29, Turin (Italie).

Article (a-revue à facteur d'impact)

Reclassification of Xanthomonads associated with anacardiaceae into two species and three pathovars

Ah-You N., Gagnevin L., Grimont P.A.D., Brisse S., Nesme X., Chiroleu F., Bui Thi Ngoc L., Jouen E., Lefeuvre P., Vernière C., Pruvost O.. 2008. Journal of Plant Pathology, 90 (2) : S2.352. International Congress of Plant Pathology. 9, 2008-08-24/2008-08-29, Turin (Italie).

Article (a-revue à facteur d'impact)

Développement d'un schéma MLVA pour analyser la diversité génétique intrapathovar chez Xanthomonas citri

Bui Thi Ngoc L., Vital K., Javegny S., Moreau A., Guérin F., Vernière C., Chiroleu F., Gagnevin L., Pruvost O.. 2008. In : 8èmes Rencontres plantes-bactéries,14-18 janvier 2008, Aussois, France. s.l. : s.n., 1 p.. Rencontres plantes-bactéries. 8, 2008-01-14/2008-01-18, Aussois (France).

Communication de congrès

Grand rangement chez Xanthomonas campestris pv. mangiferaeindicae : trois pathovars, deux espèces

Ah-You N., Gagnevin L., Grimont P.A.D., Brisse S., Nesme X., Chiroleu F., Bui Thi Ngoc L., Jouen E., Lefeuvre P., Vernière C., Pruvost O.. 2008. In : 8èmes Rencontres plantes-bactéries,14-18 janvier 2008, Aussois, France. s.l. : s.n., 1 p.. Rencontres plantes-bactéries. 8, 2008-01-14/2008-01-18, Aussois (France).

Communication de congrès

First report in Myanmar of Xanthomonas axonopodis pv. mangiferaeindicae causing mango bacterial canker on Mangifera indica

Ah-You N., Gagnevin L., Pruvost O., Myint N.T., Johnson G.I.. 2007. Plant Disease, 91 (12) : p. 1686-1686.

DOI: 10.1094/PDIS-91-12-1686A

Article (a-revue à facteur d'impact)

First report in New Caledonia of bacterial blight of anthurium caused by Xanthomonas axonopodis pv. diffenbachiae

Jouen E., Laurent P., Robène-Soustrade I., Gagnevin L., Pruvost O., Hostachy B., Gâteblé G., Amice R., Imbert F.. 2007. Plant Disease, 91 (4) : p. 462-462.

DOI: 10.1094/PDIS-91-4-0462B

Article (a-revue à facteur d'impact)

Pathological variations within Xanthomonas campestris pv. mangiferaeindicae support its separation into three distinct pathovars that can be distinguished by amplified fragment length polymorphism

Ah-You N., Gagnevin L., Chiroleu F., Jouen E., Rodrigues Neto J., Pruvost O.. 2007. Phytopathology, 97 (12) : p. 1568-1577.

DOI: 10.1094/PHYTO-97-12-1568

Article (a-revue à facteur d'impact)

Phylogeography of the green turtle, Chelonia mydas, in the southwest Indian Ocean

Bourjea J., Lapègue S., Gagnevin L.. 2007. Molecular Ecology, 16 (1) : p. 175-186.

DOI: 10.1111/j.1365-294X.2006.03122.x

Article (a-revue à facteur d'impact)

Insights into structure and evolution of bacterial species that are revealed by molecular methods

Roumagnac P., Gagnevin L., Pruvost O., Achtman M.. 2007. In : Tibayrenc Michel (ed.). Encyclopedia of infectious diseases : modern methodologies. Hoboken : Wiley-Blackwell, p. 473-493.

Chapitre d'ouvrage

Un diagnostic universel et précoce du dépérissement bactérien de l'anthurium

Soustrade I., Gagnevin L.. 2007. In : Gay Jean-Pierre (ed.). Le Cirad à la Réunion en 2006. Montpellier : CIRAD, p. 14-15.

Chapitre de rapport

Quantitative and molecular epidemiology of bacterial blight of onion in seed production fields

Humeau L., Roumagnac P., Picard Y., Soustrade I., Chiroleu F., Gagnevin L., Pruvost O.. 2006. Phytopathology, 92 (12) : p. 1345-1354.

DOI: 10.1094/PHYTO-96-1345

Article (a-revue à facteur d'impact)

Specific detection of Xanthomonas axonopodis pv. dieffenbachiae in anthurium (Anthurium andreanum) tissues by nested PCR

Robène-Soustrade I., Laurent P., Gagnevin L., Jouen E., Pruvost O.. 2006. Applied and Environmental Microbiology, 72 (2) : p. 1072-1078.

DOI: 10.1128/AEM.72.2.1072-1078.2006

Article (a-revue à facteur d'impact)

Etude de la taxonomie des Xanthomonas associées aux anacardiacées

Ah-You N., Gagnevin L., Pruvost O.. 2006. In : SFP. 7èmes Rencontres plantes-bactéries, 20-23 mars 2006, Aussois, France. Résumés. Angers : INRA, p. 30-30. Rencontres plantes-bactéries. 7, 2006-03-20/2006-03-24, Aussois (France).

Communication de congrès

L'aptitude à la transmission : un paramètre clé de la fitness épidémique chez les Xanthomonas

Pruvost O., Glories V., Mondon F., Vital K., Chiroleu F., Gagnevin L.. 2006. In : SFP. 7èmes Rencontres plantes-bactéries, 20-23 mars 2006, Aussois, France. Résumés. Angers : INRA, p. 27-27. Rencontres plantes-bactéries. 7, 2006-03-20/2006-03-24, Aussois (France).

Communication de congrès

Le dépérissement bactérien de l'anthurium (Anthurium andreanum) provoqué par Xanthomonas axonopodis pv. dieffenbachiae : mise au point d'une BIO-nested PCR pour la certification

Laurent P., Robène-Soustrade I., Legrand D., Gagnevin L., Jouen E., Pruvost O.. 2006. In : SFP. 7èmes Rencontres plantes-bactéries, 20-23 mars 2006, Aussois, France. Résumés. Angers : INRA, p. 94-94. Rencontres plantes-bactéries. 7, 2006-03-20/2006-03-24, Aussois (France).

Communication de congrès

Une nouvelle famille d'éléments insertionnels chez les Xanthomonas

Gagnevin L., Le Bleis L., Pruvost O., Siguier P., Chandler M.. 2006. In : SFP. 7èmes Rencontres plantes-bactéries, 20-23 mars 2006, Aussois, France. Résumés. Angers : INRA, p. 89-89. Rencontres plantes-bactéries. 7, 2006-03-20/2006-03-24, Aussois (France).

Communication de congrès

Test de détection de Xanthomonas axonopodis pv dieffenbachiae

Robène-Soustrade I., Laurent P., Gagnevin L.. 2006. Paris : INPI, 24 p.. numero_brevet: FR2848222 B1; num.

Brevet

New media for the semiselective isolation and enumeration of Xanthomonas campestris pv. mangiferaeindicae, the causal agent of mango bacterial black spot

Pruvost O., Roumagnac P., Gaube C., Chiroleu F., Gagnevin L.. 2005. Journal of Applied Microbiology, 99 (4) : p. 803-815.

DOI: 10.1111/j.1365-2672.2005.02681.x

Article (a-revue à facteur d'impact)

Impact of partial resistance in mango to Xanthomonas sp. pv. Mangiferaeindicae on temporal and spatial development of bacterial black spot disease

Pruvost O., Glories V., Chiroleu F., Gagnevin L.. 2005. In : 9th International Workshop on Plant disease epidemiology, Landerneau, France, 11-15 April 2005. s.l. : s.n., 1 p.. International Workshop on Plant Disease Epidemiology. 9, 2005-04-11/2005-04-15, Landerneau (France).

Communication de congrès

Polyphasic characterization of xanthomonads isolated from onion, garlic and Welsh onion (Allium spp.) and their relatedness to different Xanthomonas species

Roumagnac P., Gagnevin L., Gardan L., Sutra L., Manceau C., Dickstein E.R., Jones J.B., Rott P., Pruvost O.. 2004. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 54 : p. 15-24.

DOI: 10.1099/ijs.0.02714-0

Article (a-revue à facteur d'impact)

Une maladie émergente de l'oignon à la Réunion : le dépérissement bactérien causé par Xanthomonas axonopodis pv. allii

Humeau L., Roumagnac P., Soustrade I., Gagnevin L., Degas J., Jeuffrault E., Pruvost O.. 2004. Phytoma-La Défense des Végétaux (573) : p. 28-30.

Article (b-revue à comité de lecture)

Caractérisation polyphasique des Xanthomonas isolé d'oignon, d'ail et de ciboule

Roumagnac P., Gagnevin L., Gardan L., Sutra L., Manceau C., Rott P., Pruvost O.. 2004. In : 6ème Rencontres plantes-bactéries, 11-15 janvier 2004, Aussois. s.l. : s.n., p. 74-74. Rencontres plantes-bactéries. 6, 2004-01-11/2004-01-15, Aussois (France).

Communication de congrès

Protection des plantes - Epidémiologie des maladies bactériennes et virales

Costet L., Pruvost O., Gagnevin L., Laurent P., Jouen E., Humeau L., Roumagnac P., Soustrade I., Elbaz M., Luisetti J., Delatte H., Lett J.M., Laurent P.. 2004. In : De Taffin Gabriel (ed.). Rapport annuel 2003 CIRAD Réunion. Saint-Denis : CIRAD, p. 52-58.

Chapitre de rapport

Protection des plantes - Epidémiologie des maladies bactériennes et virales

Gagnevin L., Humeau L., Roumagnac P., Robène-Soustrade I., Pruvost O., Delatte H., Reynaud B., Lett J.M., Costet L., Pompon J.. 2004. In : De Taffin Gabriel (ed.). Rapport annuel 2004 CIRAD Réunion. Saint-Denis : CIRAD, p. 56-62.

Chapitre de rapport

Durability of a partial resistance in mango against Xanthomonas pv. mangiferaeindicae

Gagnevin L., Pruvost O.. 2003. In : ISPP. Solving problems in the real world : ICPP 2003, 8th International Congress of Plant Pathology, 2-7 February 2003, Christchurch, New-Zealand. s.l. : s.n., 1 p.. International Congress of Plant Pathology. 8, 2003-02-02/2003-02-07, Christchurch (Nouvelle-Zélande).

Communication de congrès

Genetic diversity and variability in pathogenicity of xanthomonads pathogenic to sugarcane

Costet L., Gagnevin L., Notaise J., Drouet D., Rott P.. 2003. In : Pathology Workshop of the International Society of Sugar Cane Technologists, Baton Rouge, Etats-Unis, 11-16 may 2003. Montpellier : CIRAD, 1 p.. ISSCT Pathology Workshop. 7, 2003-05-11/2003-05-16, Baton Rouge (Etats-Unis).

Communication de congrès

Genetic diversity and variability in pathogenicity of xanthomonads pathogenic to sugarcane in Réunion Island

Costet L., Gagnevin L., Notaise J., Drouet D., Rott P.. 2003. In : Pathology Workshop of the International Society of Sugar Cane Technologists, Baton Rouge, Etats-Unis, 11-16 may 2003. s.l. : s.n., 1 p.. ISSCT Pathology Workshop. 7, 2003-05-11/2003-05-16, Baton Rouge (Etats-Unis).

Communication de congrès

Le dépérissement bactérien des Alliacées : la biologie moléculaire est-elle un outil performant dans la stratégie de lutte ?

Roumagnac P., Pruvost O., Gagnevin L.. 2003. In : Kahane Rémi (ed.). Productions maraîchères et horticoles : sessions lutte intégrée et agronomie. Montpellier : CIRAD-FLHOR, 1 Cd-Rom. Journées annuelles du FLHOR, 2002-08-26/2002-08-27, Montpellier (France).

Communication de congrès

Onion bacterial blight: new data on an emerging disease

Roumagnac P., Gagnevin L., Hughes G., Pruvost O.. 2003. In : ISPP. Solving problems in the real world : ICPP 2003, 8th International Congress of Plant Pathology, 2-7 February 2003, Christchurch, New-Zealand. s.l. : s.n., 9 p.. International Congress of Plant Pathology. 8, 2003-02-02/2003-02-07, Christchurch (Nouvelle-Zélande).

Communication de congrès

Protection des plantes. Epidémiologie des maladies bactériennes et virales

Pruvost O., Gagnevin L., Laurent P., Soustrade I., Roumagnac P., Luisetti J., Rassaby L., Reynaud B., Delatte H.. 2003. In : De Taffin Gabriel (ed.). Rapport annuel 2002 CIRAD Réunion. Saint-Denis : CIRAD, p. 52-58.

Chapitre de rapport

Dépérissement de l'anthurium dû à Xanthomonas axonopodis pv. Dieffenbachiae (Xad) : bilan de trois ans de lutte à la Réunion : vigilance !

Jeuffrault E., Soustrade I., Laurent P., Gagnevin L., Henry G.. 2002. Phytoma-La Défense des Végétaux (551) : p. 46-48.

Article (b-revue à comité de lecture)

Population structure of xanthomonas with endophytic and epiphytic phases : The pathovar mangiferaeindicae/ Mango pathosystem

Pruvost O., Gagnevin L.. 2002. In : by S.E. Lindow, E.I. Hecht-Oiner abd V.J. Elliot (eds.). Phyllosphere microbiology. Saint Paul : Ed. APS Press, p. 209-221.

Chapitre d'ouvrage

Bactériose du manguier (démarche prophylactique)

Pruvost O., Gagnevin L.. 2002. In : Journée manguier - Réunion annuelle CIRAD-Flhor Programme arboriculture fruitière, 3 septembre 2001. Montpellier : CIRAD-FLHOR, 1 Cd-Rom. Réunion annuelle 2001 CIRAD-FLHOR, 2001-09-03/2001-09-06, Montpellier (France).

Communication de congrès

Développement spatio-temporel de la maladie des taches noires (Xanthomonas sp. pv. mangiferaeindicae) sur un cultivar sensible et un cultivar partiellement résistant de manguier

Pruvost O., Glories V., Manicom B., Gagnevin L.. 2002. In : Rencontres de bactériologie, Aussois, France, 13-17 janvier 2002. s.l. : s.n., 1 p.. Rencontres de bactériologie. 5, 2002-01-13/2002-01-17, Aussois (France).

Communication de congrès

Diversité génétique et variabilité du pouvoir pathogène des Xanthomonas pathogènes de la canne à sucre à la Réunion

Costet L., Gagnevin L., Notaise J., Rott P.. 2002. In : Rencontres de bactériologie, Aussois, France, 13-17 janvier 2002. s.l. : s.n., 1 p.. Rencontres de bactériologie. 5, 2002-01-13/2002-01-17, Aussois (France).

Communication de congrès

Etude de la diversité génétique existant au sein d'une collection de souches de Xanthomonas sp. pathogènes de l'oignon par AFLP et PFLP

Roumagnac P., Gagnevin L., Sellos S., Brin C., Manceau C., Pruvost O.. 2002. In : Rencontres de bactériologie, Aussois, France, 13-17 janvier 2002. s.l. : s.n., 1 p.. Rencontres de bactériologie. 5, 2002-01-13/2002-01-17, Aussois (France).

Communication de congrès

Mise au point d'un test de détection PCR in vitro et in planta de Xanthomonas axonopodis pv. dieffenbachiae, agent du dépérissement bactérien de l'Anthurium

Soustrade I., Laurent P., Gagnevin L.. 2002. In : Cinquièmes rencontres de bactériologie, Aussois, France, 13-17 janvier 2002. s.l. : s.n., 1 p.. Rencontres de bactériologie. 5, 2002-01-13/2002-01-17, Aussois (France).

Communication de congrès

Structure des populations de Xanthomonas pv. mangiferaeindicae présentes sur un cultivar sensible et un cultivar partiellement résistant de manguier

Gagnevin L., Pruvost O., Flahaut B., Bunner D., Laplace D.. 2002. In : Cinquièmes rencontres de bactériologie, Aussois, France, 13-17 janvier 2002. s.l. : s.n., 1 p.. Rencontres de bactériologie. 5, 2002-01-13/2002-01-17, Aussois (France).

Communication de congrès

Protection des plantes. Epidémiologie des maladies bactériennes et virales

Costet L., Gagnevin L., Pruvost O., Laurent P., Soustrade I., Roumagnac P., Luisetti J., Rassaby L., Leclercq Le Quillec F., Reynaud B.. 2002. In : Trébel Michel (ed.). Rapport annuel 2001 CIRAD Réunion. Saint-Denis : CIRAD, p. 56-61.

Chapitre de rapport

Epidemology and control of mango bacterial black spot

Gagnevin L., Pruvost O.. 2001. Plant Disease, 85 (9) : p. 928-935.

DOI: 10.1094/PDIS.2001.85.9.928

Article (a-revue à facteur d'impact)

Epidémiologie moléculaire de la maladie des taches noires du manguier : Intérêt de l'IS1595 en tant qu'outil de typage

Pruvost O., Gagnevin L., Glories V., Couteau A., Mete K.. 2001. In : SFP. 5e Congrès de la Société Française de Phytopathologie, Angers (France), 26 - 29 mars 2001. Programme et résumés des communications,. Angers : INRA, 1 p.. Congrès de la Société Française de Phytopathologie. 5, 2001-03-26/2001-03-29, Angers (France).

Communication de congrès

Epidemiology and population structure of Xanthomonas pv. mangiferaeindicae present on partially resistant and susceptible mango cultivars

Pruvost O., Gagnevin L., Glories V., Couteau A., Mete K., Flahaut B.. 2001. In : 39th Congress of the Southern African Society for Plant Pathology, Nelspruit, Afrique du Sud, 21 au 24 janvier 2001. s.l. : s.n., 1 p.. Congress of the Southern African Society for Plant Pathology. 39, 2001-01-21/2001-01-24, Nelspruit (Afrique du Sud).

Communication de congrès

Etude de l'influence de l'hôte sur la structure des populations de Xanthomonas pv. mangiferaeindicae, agent de la maladie des tâches noires du manguier par typage moléculaire à l'aide de l'IS1595 et d'un gène d'avirulence

Gagnevin L., Flahaut B., Glories V., Pruvost O.. 2001. In : SFP. 5e Congrès de la Société Française de Phytopathologie, Angers (France), 26 - 29 mars 2001. Programme et résumés des communications. Angers : INRA, p. 28-28. Congrès de la Société Française de Phytopathologie. 5, 2001-03-26/2001-03-29, Angers (France).

Communication de congrès

Mise au point d'un test de détection PCR de Xanthomonas axonopodis pv. dieffenbachiae, agent du dépérissement bactérien de l'anthurium

Soustrade I., Gagnevin L.. 2001. In : SFP. 5e Congrès de la Société Française de Phytopathologie, Angers (France), 26 - 29 mars 2001. Programme et résumés des communications. Angers : INRA, p. 18-18. Congrès de la Société Française de Phytopathologie. 5, 2001-03-26/2001-03-29, Angers (France).

Communication de congrès

Protection des plantes. Epidémiologie des maladies bactériennes et virales

Notaise J., Gagnevin L., Luisetti J., Poussier S., Roumagnac P., Pruvost O., Soustrade I., Rassaby L., Leclercq Le Quillec F., Reynaud B., Peterschmitt M.. 2001. In : Trébel Michel (ed.). Rapport annuel 2000 CIRAD Réunion. Saint-Denis : CIRAD, p. 56-62.

Chapitre de rapport

Detection of Xanthomonas sp., the causal agent of onion bacterial blight, in onion seeds using a newly developed semi-selective isolation medium

Roumagnac P., Gagnevin L., Pruvost O.. 2000. European Journal of Plant Pathology, 106 (9) : p. 867-877.

DOI: 10.1023/A:1008743120242

Article (a-revue à facteur d'impact)

Protection des plantes. Epidémiologie des maladies virales et bactériennes

Luisetti J., Poussier S., Fock I., Roumagnac P., Gagnevin L., Notaise J., Soustrade I., Pruvost O., Rassaby L., Leclerc F., Reynaud B., Peterschmitt M.. 2000. Magazine CIRAD Réunion (17) : p. 50-55.

Article (c-notoriété en attente de mise à jour)

Interest of the insertion sequence IS1595 as a population typing tool for Xanthomonas pv. mangiferaeindicae

Gagnevin L., Glories V., Couteau A., Mete K., Gout L., Pruvost O.. 2000. In : Biodiversity in plant pathology. Book of abstracts : 5th Congress of the European Foundation for Plant Pathology, Italy, 18-22 september 2000, EFPP. s.l. : s.n., p. 37-37. European Foundation for Plant Pathology Congress. 5, 2000-09-18/2000-09-22, Taormina - Giardini Naxos (Italie).

Communication de congrès

Phenotypic and genetic diversity of Xanthomonads associated with Anacardiaceae

Pruvost O., Gagnevin L., Glories V., Couteau A., Some A., Samson R.. 2000. In : Subhadrabandhu Suranant (ed.), Pichakum Aussanee (ed.). Proceedings of the Sixth International Symposium on Mango, Pattaya City (Thailand), 6-9 April, 1999. Wageningen : ISHS [Pays-Bas], p. 793-801. (Acta Horticulturae, 509). International Symposium on Mango. 2, 1985-05-20/1985-05-24, Bangalore (Inde).

Communication de congrès

Protection des plantes

Reynaud B., Luisetti J., Poussier S., Roumagnac P., Pruvost O., Gagnevin L., Girard J.C., Rassaby L., Leclercq Le Quillec F., Goebel F.R., Vayssières J.F., Quilici S., Brévault T., Hurtrel B.. 1999. Magazine CIRAD Réunion (14) : p. 47-54.

Article (c-notoriété en attente de mise à jour)

Maladie des taches noires du manguier : un point sur les connaissances acquises et les perspectives de recherche

Pruvost O., Gagnevin L., Glories V., Couteau A.. 1999. In : Réunion annuelle 1998 Cirad-Flhor du 31 août au 4 septembre 1998. Recueil des communications. Arboriculture fruitère du 31/08 au 02/09/98, journées "semences et plants" du 03/09 au 04/09/98. Montpellier : CIRAD-FLHOR, 3 p.. Réunion annuelle CIRAD-FLHOR, 1998-08-31/1998-09-04, Montpellier (France).

Communication de congrès

Assessment by RFLP analysis of the population structure of Xanthomonas pathovar mangiferaeindicae within a single field containing two host species

Gagnevin L., Pruvost O.. 1998. In : BSPP; ISPP. ICPP98. Offered papers. Abstracts (themes 1 and 2). Birmingham : BSPP, p. 36-36. International Congress of Plant Pathology. 7, 1998-08-09/1998-08-16, Edimbourg (Royaume-Uni).

Communication de congrès

Analyse de la diversité génétique de Xanthomonas pv. Mangiferaeindicae et sa signification dans le pouvoir pathogène et la biologie de la bactérie : Implications dans l'épidémiologie de la maladie des tâches noires du manguier à l'Île de La Réunion

Gagnevin L.. 1998. Paris : INA-PG, 142 p.. Thèse de doctorat -- Agronomie.

Thèse

Genomic variability of the Xanthomonas pathovar mangiferaeindica, agent of mango bacterial black spot

Gagnevin L., Leach J., Pruvost O.. 1997. Applied and Environmental Microbiology, 63 (1) : p. 246-253.

DOI: 10.1128/AEM.63.1.246-253.1997

Article (a-revue à facteur d'impact)

Protection des plantes. Inventaires des ennemis des cultures et protection des plantes

Gagnevin L., Girard J.C., Goebel F.R., Grisoni M., Luisetti J., Pruvost O., Quilici S., Roumagnac P., Vayssières J.F.. 1997. Magazine CIRAD Réunion (7) : p. 48-54.

Article (c-notoriété en attente de mise à jour)

Protection des plantes. Inventaire des ennemis des cultures et protection des plantes

Gagnevin L., Girard J.C., Goebel F.R., Grisoni M., Pruvost O., Reynaud B., Quilici S.. 1996. Magazine CIRAD Réunion (3) : p. 50-54.

Article (c-notoriété en attente de mise à jour)

Assessment of genomic variability in Xanthomonas campestris pv. mangiferaeindicae

Gagnevin L., Pruvost O.. 1995. Phytopathology, 85 (10) : p. 1163-1163. APS Annual Meeting, 1995-08-12/1995-08-16, Pittsburg (Etats-Unis).

Article (a-revue à facteur d'impact)

Assessment of genomic variability in Xanthomonas campestris pv. mangiferaeindicae, causal agent of mango black spot

Gagnevin L.. 1993. Paris : INA-PG, 29 p.. Mémoire DEA -- Fin d'Etudes en Phytopathologie.

Mémoire

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