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Unité d'affectation : UMR AGAP (Bios)
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70 publications

Deciphering the genetic basis of adaptation to environment in T. cacao using resequenced genomes

Fouet O., Loor Solorzano R.G., Lemainque A., Lanaud C., Argout X.. 2023. In : International Symposium on Cocoa Research 2022 - ISCR 2022. Booklet of Abstracts. Montpellier : ICCO; CIRAD, p. 210-211. International Symposium on Cocoa Research (ISCR 2022), 2022-12-05/2022-12-07, Montpellier (France).

Résumé

Communication de congrès

Genetic diversity analysis of a large cocoa trees collection from the Ecuadorian Amazon safeguarded for local and sustainable cocoa production

Fouet O., Loor Solorzano R.G., Rhone B., Subia C., Calderón D., Fernández F.. 2023. In : International Symposium on Cocoa Research 2022 - ISCR 2022. Booklet of Abstracts. Montpellier : ICCO; CIRAD, p. 248-249. International Symposium on Cocoa Research (ISCR 2022), 2022-12-05/2022-12-07, Montpellier (France).

Résumé

Communication de congrès

Collection of native Theobroma cacao L. accessions from the Ecuadorian Amazon highlights a hotspot of cocoa diversity

Fouet O., Loor R.G., Rhone B., Subia C., Calderón D., Fernández F., Sotomayor I., Rivallan R., Colonges K., Vignes H., Angamarca F., Yaguana B., Costet P., Argout X., Lanaud C.. 2022. Plants, People, Planet, 4 (6) : p. 605-617.

DOI: 10.1002/ppp3.10282

Résumé

Article (a-revue à facteur d'impact)

Diversity and determinants of bitterness, astringency, and fat content in cultivated Nacional and native Amazonian cocoa accessions from Ecuador

Colonges K., Seguine E., Saltos A., Davrieux F., Minier J., Jimenez J.C., Lahon M.C., Calderón D., Subia C., Sotomayor I., Fernández F., Fouet O., Rhone B., Argout X., Lebrun M., Costet P., Lanaud C., Boulanger R., Loor Solorzano R.G.. 2022. Plant Genome, 15 (4) : 16 p..

DOI: 10.1002/tpg2.20218

Résumé

Article (a-revue à facteur d'impact)

Genome-wide association studies and genomic selection assays made in a large sample of cacao (Theobroma cacao L.) germplasm reveal significant marker-trait associations and good predictive value for improving yield potential

Bekele F.L., Bidaisee G., Allegre M., Argout X., Fouet O., Boccara M., Saravanakumar D., Bekele I., Lanaud C.. 2022. PloS One, 17 (10) : 35 p..

DOI: 10.1371/journal.pone.0260907

Résumé

Article (a-revue à facteur d'impact)

Integration of GWAS, metabolomics, and sensorial analyses to reveal novel metabolic pathways involved in cocoa fruity aroma GWAS of fruity aroma in Theobroma cacao

Colonges K., Jimenez J.C., Saltos A., Seguine E., Loor Solorzano R.G., Fouet O., Argout X., Assemat S., Davrieux F., Cros E., Lanaud C., Boulanger R.. 2022. Plant Physiology and Biochemistry, 171 : p. 213-225.

DOI: 10.1016/j.plaphy.2021.11.006

Résumé

Article (a-revue à facteur d'impact)

Variability and genetic determinants of cocoa aromas in trees native to South Ecuadorian Amazonia

Colonges K., Loor Solorzano R.G., Jimenez J.C., Lahon M.C., Seguine E., Calderón D., Subia C., Sotomayor I., Fernández F., Lebrun M., Fouet O., Rhone B., Argout X., Costet P., Lanaud C., Boulanger R.. 2022. Plants, People, Planet, 4 (6) : p. 618-637.

DOI: 10.1002/ppp3.10268

Résumé

Article (a-revue à facteur d'impact)

Two main biosynthesis pathways involved in the synthesis of the floral aroma of the nacional cocoa variety

Colonges K., Jimenez J.C., Saltos A., Seguine E., Loor Solorzano R.G., Fouet O., Argout X., Assemat S., Davrieux F., Cros E., Boulanger R., Lanaud C.. 2021. Frontiers in Plant Science, 12 : 24 p..

DOI: 10.3389/fpls.2021.681979

Résumé

Article (a-revue à facteur d'impact)

Genetic bases of fruity notes (fresh and dried) of the Nacional cocoa variety

Colonges K., Jimenez J.C., Saltos A., Seguin E., Solorzano R.L., Fouet O., Argout X., Assemat S., Davrieux F., Morillo E., Boulanger R., Cros E., Lanaud C.. 2021. In : Guichard Elisabeth (ed.), Le Quéré Jean-Luc (ed.). Progress in flavour research 2021. Proceedings of the 16th Weurman Flavour Research Symposium. Dijon : INRAE; CSGA, p. 359-364. Weurman Flavour Research Symposium. 16, 2021-05-04/2021-05-06, Dijon (France).

Résumé

Communication de congrès

Early Cacao Use in the Upper Amazon of South America

Zarrillo S., Gaikwad N., Lanaud C., Powis T., Viot C., Lesur I., Fouet O., Argout X., Guichoux E., Salin F., Solorzano R.L., Bouchez O., Vignes H., Severts P., Hurtado J., Yepez A., Grivetti L., Blake M., Valdez F.. 2019. Vancouver : Society of Ethnobiology, 1 p.. Annual Conference of the Society of Ethnobiology. 42, 2019-05-08/2019-05-11, Vancouver (Canada).

Résumé

Communication de congrès

Assessment of genetic diversity and structure in cocoa trees (Theobroma cacao L.) in Côte d'Ivoire with reference to their susceptibility to Cocoa swollen shoot virus disease (CSSVD)

Guiraud B.S.H., Tahi G.M., Fouet O., Trebissou C.I., Pokou N.D., Rivallan R., Argout X., Koffi K.C., Koné B., Zoro Bi A.I., Lanaud C.. 2018. Tree Genetics and Genomes, 14 (52) : 21 p..

DOI: 10.1007/s11295-018-1264-y

Résumé

Article (a-revue à facteur d'impact)

The use and domestication of Theobroma cacao during the mid-Holocene in the upper Amazon

Zarrillo S., Gaikwad N., Lanaud C., Powis T., Viot C., Lesur I., Fouet O., Argout X., Guichoux E., Salin F., Loor Solorzano R.G., Bouchez O., Vignes H., Severts P., Hurtado J., Yepez A., Grivetti L., Blake M., Valdez F.. 2018. Nature Ecology and Evolution, 2 : p. 1879-1888.

DOI: 10.1038/s41559-018-0697-x

Résumé

Article (a-revue à facteur d'impact)

Deciphering the Theobroma cacao self-incompatibility system: from genomics to diagnostic markers for self-compatibility

Lanaud C., Fouet O., Legavre T., Lopes U.V., Sounigo O., Eyango M.C., Mermaz B., da Silva M.R., Loor Solorzano R.G., Argout X., Gyapay G., Ebaiarrey H.E., Colonges K., Sanier C., Rivallan R., Mastin G., Cryer N., Boccara M., Verdeil J.L., Efombagn M.I.B., Peres Gramacho K., Clément D.. 2017. Journal of Experimental Botany, 68 (17) : p. 4775-4790.

DOI: 10.1093/jxb/erx293

Résumé

Article (a-revue à facteur d'impact)

Evolutionary forces affecting synonymous variations in plant genomes

Clément Y., Sarah G., Holtz Y., Homa F., Pointet S., Contreras S., Nabholz B., Sabot F., Sauné L., Ardisson M., Bacilieri R., Besnard G., Berger A., Cardi C., De Bellis F., Fouet O., Jourda C., Khadari B., Lanaud C., Leroy T., Pot D., Sauvage C., Scarcelli N., Tregear J., Vigouroux Y., Yahiaoui N., Ruiz M., Santoni S., Labouisse J.P., Pham J.L., David J., Glemin S.. 2017. PLoS Genetics, 13 (5) : 28 p..

DOI: 10.1371/journal.pgen.1006799

Résumé

Article (a-revue à facteur d'impact)

The cacao Criollo genome v2.0: An improved version of the genome for genetic and functional genomic studies

Argout X., Martin G., Droc G., Fouet O., Labadie K., Rivals E., Aury J.M., Lanaud C.. 2017. BMC Genomics, 18 : 9 p..

DOI: 10.1186/s12864-017-4120-9

Résumé

Article (a-revue à facteur d'impact)

Desarrollo de nichos específicos de cacao con alta productividad y calidad sensorial: experiencia ecuatoriana

Loor R.G., Amores F., Vasco S.A., Eskes A., Quiroz J.G., Suárez C., Motamayor J.C., Schnell R.J., Zambrano J., Calderón D., Jimenez J.C., Tarqui O., Rosenquist E., Lanaud C., Fouet O., Argout X., Valdez F., Lachenaud P., Costet P., Quijano G.C., Teran M.M., Sotomayor Cantos I.A., Casanova T., Subia C.. 2017. In : Proceedings of the International Symposium on Cocoa Research 2017. Lima : ICCO, 15 p.. International Symposium on Cocoa Research (ISCR 2017). 1, 2017-11-13/2017-11-17, Lima (Pérou).

Résumé

Communication de congrès

Exploration of the T. cacao genome sequence to decipher the incompatibility system of Theobroma cacao and to identify diagnostic markers

Lanaud C., Fouet O., Legavre T., Lopes U.V., Sounigo O., Eyango M.C., Mermaz B., da Silva M.R., Loor Solorzano R.G., Argout X., Gyapay G., Ebaiarrey H.E., Colonges K., Sanier C., Rivallan R., Mastin G., Cryer N., Boccara M., Efombagn M.I.B., Gramacho K.P., Clément D.. 2017. In : Proceedings of the first International Symposium on Cocoa Research ISCR 2017. Lima : ICCO, 11 p.. International Symposium on Cocoa Research – ISCR 2017 : Promoting Advances in Research to Enhance the Profitability of Cocoa Farming. 1, 2017-11-13/2017-11-17, Lima (Pérou).

Résumé

Communication de congrès

The Genomic Selection of Theobroma cacao: a new strategy of marker assisted selection to improve breeding efficiency and predict useful traits in new populations. [20]

Ribeyre F., Sounigo O., Argout X., Cilas C., Efombagn M.I.B., Denis M., Bouvet J.M., Fouet O., Lanaud C.. 2017. In : Proceedings of the International Symposium on cocoa research. Lima : ICCO, 7 p.. International Symposium on Cocoa Research (ISCR 2017). 1, 2017-11-13/2017-11-17, Lima (Pérou).

Résumé

Communication de congrès

Association mapping of seed and disease resistance traits in Theobroma cacao L.

Motilal L.A., Zhang D., Mischke S., Meinhardt L.W., Boccara M., Fouet O., Lanaud C., Umaharan P.. 2016. Planta, 244 (6) : p. 1265-1276.

DOI: 10.1007/s00425-016-2582-7

Résumé

Article (a-revue à facteur d'impact)

Cacao trees (Theobroma cacao L.) of the "Guiana" genetic group: "Tanpok 2012" survey

Lachenaud P., Fouet O., Couturier C., Lanaud C.. 2016. Genetic Resources and Crop Evolution, 63 (5) : p. 781-790.

DOI: 10.1007/s10722-015-0280-0

Résumé

Article (a-revue à facteur d'impact)

Association mapping for Phytophthora pod rot resistance in a cacao (Theobroma cacao L.) population grown in farmers' field

Efombagn M.I.B., Sounigo O., Courtois B., Fouet O., Jeanneau M., Lemainque A., Pavek S., Lanaud C.. 2016. International Journal of Agriculture and Biosciences, 5 (6) : p. 329-336.

Résumé

Article (b-revue à comité de lecture)

Mapping QTLs for Black pod (Phytophthora palmivora) resistance in three hybrid progenies of cocoa (Theobroma cacao L.) using SSR markers

Akaza J.M., Kouassi A.B., Akaffou D.S., Fouet O., N'Guetta A.S.P., Lanaud C.. 2016. International Journal of Scientific and Research Publications, 6 (1) : p. 298-311.

Résumé

Article (b-revue à comité de lecture)

Identification of Theobroma cacao genes differentially expressed during Phytophthora megakarya infection

Legavre T., Ducamp M., Sabau X., Argout X., Fouet O., Dedieu F., Surujdeo-Maharaj S., Garcia D., Paulin D., Lanaud C.. 2015. Physiological and Molecular Plant Pathology, 92 : p. 1-13.

DOI: 10.1016/j.pmpp.2015.08.005

Résumé

Article (a-revue à facteur d'impact)

Rescue of cacao genetic resources related to the nacional variety: Surveys in the Ecuadorian Amazon (2010-2013)

Loor R.G., Lachenaud P., Fouet O., Argout X., Peña G., Macias J.C., Amores Puyutaxi F.M., Valdez F., Hurtado J., Lanaud C.. 2015. Revista ESPAMCiencia, 6 (E) : p. 7-15.

Résumé

Article (b-revue à comité de lecture)

A newly identified locus controls complete resistance to Microcyclus ulei in the Fx2784 rubber clone

Le Guen V., Garcia D., Mattos C.R.R., Fouet O., Doare F., Condina V., Seguin M.. 2013. Tree Genetics and Genomes, 9 (3) : p. 805-812.

DOI: 10.1007/s11295-013-0599-7

Résumé

Article (a-revue à facteur d'impact)

Discovery and mapping of a new expressed sequence tag-single nucleotide polymorphism and simple sequence repeat panel for large-scale genetic studies and breeding of Theobroma cacao L.

Allègre M., Argout X., Boccara M., Fouet O., Roguet Y., Bérard A., Thévenin J.M., Chauveau A., Rivallan R., Clément D., Courtois B., Gramacho K.P., Boland-Auge A., Tahi M.G., Umaharan P., Brunel D., Lanaud C.. 2012. DNA Research, 19 (1) : p. 23-35.

DOI: 10.1093/dnares/dsr039

Résumé

Article (a-revue à facteur d'impact)

Insight into the wild origin, migration and domestication history of the fine flavour nacional Theobroma cacao L. variety from Ecuador

Loor Solorzano R.G., Fouet O., Lemainque A., Pavek S., Boccara M., Argout X., Amores F., Courtois B., Risterucci A.M., Lanaud C.. 2012. PloS One, 7 (11) : 11 p..

DOI: 10.1371/journal.pone.0048438

Résumé

Article (a-revue à facteur d'impact)

A new insight in the nuclear and cytoplasmic diversity of T.Cacao: Consequences for the T. Cacao classification

Boccara M., Fouet O., Argout X., Allègre M., Pot D., Motilal L.A., Lachenaud P., Thévenin J.M., Zhang D., Umaharan P., Loor Solorzano R.G., Lanaud C.. 2012. In : COPAL. 17th Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère, Yaounde, Cameroun, 15 - 20 Octobre 2012. s.l. : s.n., 1 p.. Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 17, 2012-10-15/2012-10-20, Yaoundé (Cameroun).

Résumé

Communication de congrès

Adding value to T. cacao germplasm collections combining GWAS and genome sequence analysis. W118

Lanaud C., Santos A., Jimenez J.C., Lemainque A., Pavek S., Argout X., Fouet O., Seguine E., Assemat S., Davrieux F., Boulanger R., Cros E., Loor R.G.. 2012. In : Plant and Animal Genome XX conference, San diego, USA, January 14-18 2012,. s.l. : s.n., 1 p.. Plant and Animal Genome conference. 20, 2012-01-14/2012-01-18, San Diego (Etats-Unis).

Résumé

Communication de congrès

Dernières avancées dans le séquençage du génome de Theobroma Cacao Criollo : nouvel assemblage, annotations et outils

Argout X., Aury J.M., Guiltinan M., Droc G., Gouzy J., Maximova S.N., Fouet O., Schuster S.C., Boccara M., Clément D., Tahi G.M., Gramacho K.P., Lanaud C.. 2012. In : 17th Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère : Résumés. Lagos : Alliance des Pays Producteurs de Cacao, p. 25-25. Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 17, 2012-10-15/2012-10-20, Yaoundé (Cameroun).

Résumé

Communication de congrès

Identification de QTL pour le rendement, les caractéristiques des fèves et la résistance à Phytophthora Palmivora chez Theobroma Cacao L.

Akaza J.M., Fouet O., Kouassi A., Rivallan R., N'Guetta A.S.P., Lanaud C.. 2012. In : 17th Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère : Résumés. Lagos : Alliance des Pays Producteurs de Cacao, p. 27-27. Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 17, 2012-10-15/2012-10-20, Yaoundé (Cameroun).

Résumé

Communication de congrès

Nouveaux éclairages sur l'origine sauvage et les évènements de domestication de la variété du cacao fin nacional Theobroma Cacao L. d'équateur et l'expédition de collecte de nouvelles ressources génétiques

Loor R.G., Fouet O., Lemainque A., Pavek S., Jeanneau M., Argout X., Risterucci A.M., Boccara M., Lachenaud P., Alter P., Rosenquist E., Courtois B., Cros E., Boulanger R., Amores F., Vasco A., Medina M., Lanaud C.. 2012. In : 17th Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère : Résumés. Lagos : Alliance des Pays Producteurs de Cacao, p. 141-141. Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 17, 2012-10-15/2012-10-20, Yaoundé (Cameroun).

Résumé

Communication de congrès

Origin and domestication of the Nacional cacao variety from Ecuador and collecting expedition of new related genetic resources. W121

Loor R.G., Fouet O., Lemainque A., Pavek S., Risterucci A.M., Courtois B., Boccara M., Argout X., Lachenaud P., Rosenquist E., Cros E., Boulanger R., Amores F., Vasco A., Lanaud C.. 2012. In : Plant and Animal Genome XX conference, San Diego, USA, January 14-18 2012,. s.l. : s.n., 1 p.. Plant and Animal Genome conference. 20, 2012-01-14/2012-01-18, San Diego (Etats-Unis).

Résumé

Communication de congrès

Structural characterization and mapping of functional EST-SSR markers in Theobroma cacao

Fouet O., Allègre M., Argout X., Jeanneau M., Lemainque A., Pavek S., Boland A., Risterucci A.M., Loor R.G., Tahi G.M., Sabau X., Courtois B., Lanaud C.. 2011. Tree Genetics and Genomes, 7 (4) : p. 799-817.

DOI: 10.1007/s11295-011-0375-5

Résumé

Article (a-revue à facteur d'impact)

The genome of Theobroma cacao

Argout X., Salse J., Aury J.M., Guiltinan M.J., Droc G., Gouzy J., Allègre M., Chaparro C., Legavre T., Maximova S.N., Abrouk M., Murat F., Fouet O., Poulain J., Ruiz M., Roguet Y., Rodier-Goud M., Barbosa-Neto J.F., Sabot F., Kudrna D., Ammiraju J.S.S., Schuster S.C., Carlson J.E., Sallet E., Schiex T., Dievart A., Kramer M., Gelley L., Shi Z., Bérard A., Viot C., Boccara M., Risterucci A.M., Guignon V., Sabau X., Axtell M.J., Ma Z., Zhang Y., Brown S., Bourge M., Golser W., Song X., Clément D., Rivallan R., Tahi G.M., Akaza J.M., Pitollat B., Gramacho K.P., D'Hont A., Brunel D., Infante D., Kébé I.S., Costet P., Wing R.A., Mc Combie W.R., Guiderdoni E., Quetier F., Panaud O., Wincker P., Bocs S., Lanaud C.. 2011. Nature Genetics, 43 (2) : p. 101-108.

DOI: 10.1038/ng.736

Résumé

Article (a-revue à facteur d'impact)

Deciphering the genome structure of Theobroma cacao (W107)

Argout X., Salse J., Aury J.M., Guiltinan M.J., Droc G., Gouzy J., Allègre M., Chaparro C., Legavre T., Maximova S.N., Abrouk M., Murat F., Fouet O., Poulain J., Ruiz M., Roguet Y., Rodier-Goud M., Barbosa-Neto J.F., Sabot F., Kudrna D., Ammiraju J.S.S., Schuster S.C., Carlson J.E., Sallet E., Schiex T., Dievart A., Kramer M., Gelley L., Shi Z., Bérard A., Viot C., Boccara M., Risterucci A.M., Guignon V., Sabau X., Axtell M.J., Ma Z., Zhang Y., Brown S., Bourge M., Golser W., Song X., Clément D., Rivallan R., Tahi G.M., Akaza J.M., Pittolat B., Gramacho K.P., D'Hont A., Brunel D., Infante D., Kébé I.S., Costet P., Wing R.A., Mc Combie W.R., Guiderdoni E., Quetier F., Panaud O., Wincker P., Bocs S., Lanaud C.. 2011. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XIXth Conference, San Diego, CA (USA), January 15-19, 2011. s.l. : s.n.. Plant and Animal Genomes Conference. 19, 2011-01-15/2011-01-19, San Diego (Etats-Unis).

Résumé

Communication de congrès

QTL detection and marker assisted selection for the resistance to Phytophthora palmivora using a F2 Theobroma cacao L. progeny

Ferreira Santos R.M., Lisboa dos Santos E.S., Martins Newman Luz E.D., Allègre M., Argout X., Fouet O., Gramacho K.P., Santana D., Mello Ribeiro J.M., Primo Da Costa E., Lanaud C., Clément D.. 2011. In : INRA , AgroCampus Ouest. 15th Quantitative Trait Locus and Marker Assisted Selection Workshop : Book of abstracts, May 19-20, 2011, Rennes, France. s.l. : s.n., p. 42-42. Quantitative Trait Locus and Marker Assited Selection Workshop. 15, 2011-05-19/2011-05-20, Rennes (France).

Résumé

Communication de congrès

Sequencing the Cocoa criollo genome : An international initiative of the ICGS (International Cocoa Genome Sequencing) consortium (P050)

Argout X., Salse J., Aury J.M., Guiltinan M.J., Droc G., Gouzy J., Allègre M., Chaparro C., Legavre T., Maximova S.N., Abrouk M., Murat F., Fouet O., Poulain J., Ruiz M., Roguet Y., Rodier-Goud M., Barbosa-Neto J.F., Sabot F., Kudrna D., Ammiraju J.S.S., Schuster S.C., Carlson J.E., Sallet E., Schiex T., Dievart A., Kramer M., Gelley L., Shi Z., Bérard A., Viot C., Boccara M., Mournet P., Risterucci A.M., Guignon V., Sabau X., Axtell M.J., Ma Z., Zhang Y., Brown S., Bourge M., Golser W., Song X., Clément D., Rivallan R., Tahi G.M., Akaza J.M., Pittolat B., Gramacho K.P., D'Hont A., Brunel D., Infante D., Kébé I.S., Costet P., Wing R.A., Mc Combie W.R., Guiderdoni E., Quetier F., Panaud O., Wincker P., Bocs S., Lanaud C.. 2011. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XIXth Conference, San Diego, CA (USA), January 15-19, 2011. s.l. : s.n.. Plant and Animal Genomes Conference. 19, 2011-01-15/2011-01-19, San Diego (Etats-Unis).

Résumé

Communication de congrès

A large est resource for Theobroma cacao including cDNAS isolated from various organs and under various biotic and abiotic stresses

Lanaud C., Fouet O., Gramacho K.P., Argout X., Legavre T., Sabau X., Risterucci A.M., Wincker P., Da Silva C., Loor R.G., Lopes U.V., Cascardo J.C.M., Courtois B., Kuhn D.N., Schnell R.J., Bailey B., Babin R., Sounigo O., Ducamp M., Paulin D., Deberdt P., Verica J., Guiltinan M.J., Alemanno L., Machado R., Phillips W., Micheli F., Da Silva Gesteira A., Clément D., Maximova S.N., Boccara M., Butler D.R., Rosenquist E., Gilmour M., Glaszmann J.C.. 2010. In : 15th International Cocoa Research Conference : cocoa productivity, quality, profitability, human health and the environment. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, p. 185-191. Conférence internationale sur la recherche cacaoyère. 15, 2006-10-09/2006-10-14, San José (Costa Rica).

Résumé

Communication de congrès

Association mapping on cocoa: A way to identify functional SSR markers linked to yield, tolerance to black pod and mirids assessed in Cameroon and develop a marker assisted breeding program

Sounigo O., Efombagn B., Lemainque A., Pavek S., Fouet O., Nsouga Amougou F., Yédé, Babin R., Ten Hoopen G.M., Courtois B., Lanaud C.. 2010. In : 16th International Cocoa Research Conference. Proceedings : towards rational cocoa production and efficient use ofr a sustainable world cocoa economy. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, p. 153-158. Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 16, 2009-11-16/2009-11-21, Bali (Indonésie).

Résumé

Communication de congrès

ESTtik, a semi-automatic cDNA sequence analysis and annotation pipeline including SSR and SNP search tools

Argout X., Ruiz M., Fouet O., Lanaud C., Wincker P., Da Silva C., Courtois B.. 2010. In : 15th International Cocoa Research Conference : cocoa productivity, quality, profitability, human health and the environment. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, p. 501-506. Conférence internationale sur la recherche cacaoyère. 15, 2006-10-09/2006-10-14, San José (Costa Rica).

Résumé

Communication de congrès

Genetic diversity and possible origin of the nacional cacao type from Ecuador

Loor R.G., Risterucci A.M., Fouet O., Courtois B., Amores F., Suarez C., Jimenez J.C., Saltos A., Cros E., Rosenquist E., Vasco A., Medina M., Lanaud C.. 2010. In : 15th International Cocoa Research Conference : cocoa productivity, quality, profitability, human health and the environment. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, p. 193-202. Conférence internationale sur la recherche cacaoyère. 15, 2006-10-09/2006-10-14, San José (Costa Rica).

Résumé

Communication de congrès

Genetic identification and characterisation of new microsatellite markers derived from expressed tag sequences (est) in Theobroma cacao L.

Lanaud C., Argout X., Fouet O., Jeanneau M., Loor R.G., N'Goran J.A.K., Lemainque A., Legavre T., Sabau X., Wincker P., Da Silva C., Gramacho K.P., Risterucci A.M.. 2010. In : 15th International Cocoa Research Conference : cocoa productivity, quality, profitability, human health and the environment. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, p. 519-523. Conférence internationale sur la recherche cacaoyère. 15, 2006-10-09/2006-10-14, San José (Costa Rica).

Résumé

Communication de congrès

Identification of Theobroma cacao genes differentially expressed during Phytophthora infection

Legavre T., Gramacho K.P., Ducamp M., Sounigo O., Deberdt P., Fouet O., Sabau X., Argout X., Lanaud C.. 2010. In : 15th International Cocoa Research Conference : cocoa productivity, quality, profitability, human health and the environment. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, p. 493-500. Conférence internationale sur la recherche cacaoyère. 15, 2006-10-09/2006-10-14, San José (Costa Rica).

Résumé

Communication de congrès

Mapping a new set of gene-based markers to identify candidate genes controlling useful traits in T. cacao

Fouet O., Argout X., Allègre M., Risterucci A.M., Courtois B., Sabau X., Tahi G.M., Pavek S., Lemainque A., Boland-Auge A., Lanaud C.. 2010. In : 16th International Cocoa Research Conference. Proceedings : towards rational cocoa production and efficient use ofr a sustainable world cocoa economy. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, p. 173-178. Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 16, 2009-11-16/2009-11-21, Bali (Indonésie).

Résumé

Communication de congrès

Preliminary results on linalool synthase expression during seed development and fermentation of Nacional and Trinitario clones

Sabau X., Loor R.G., Boccara M., Fouet O., Jeanneau M., Argout X., Legavre T., Risterucci A.M., Wincker P., Da Silva C., Jimenez J.C., Cros E., Boulanger R., Alary R., Lanaud C.. 2010. In : 15th International Cocoa Research Conference : cocoa productivity, quality, profitability, human health and the environment. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, p. 507-514. Conférence internationale sur la recherche cacaoyère. 15, 2006-10-09/2006-10-14, San José (Costa Rica).

Résumé

Communication de congrès

QTL analysis in cocoa progenies located in Côte d'Ivoire for some traits of interest using SSR markers

Akaza J.M., N'Goran J.A.K., Sangare A., Fouet O., Rivallan R., Billot C., Lanaud C.. 2010. In : 16th International Cocoa Research Conference. Proceedings : towards rational cocoa production and efficient use ofr a sustainable world cocoa economy. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, p. 195-201. Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 16, 2009-11-16/2009-11-21, Bali (Indonésie).

Résumé

Communication de congrès

New insight of genetic diversity and genotype identification using SNP-gene based markers

Boccara M., Allègre M., Fouet O., Thévenin J.M., Brunel D., Bérard A., Zhang D., Butler D.R., Lanaud C.. 2010. In : Cocoa Research Unit. Annual report 2009. St Augustine : UWI, p. 50-59.

Chapitre de rapport

A genomewide admixture mapping study for yield factors and morphological traits in a cultivated cocoa (Theobroma cacao L.) population

Marcano M., Morales S., Hoyer M.T., Courtois B., Risterucci A.M., Fouet O., Pugh T., Cros E., Gonzalez V., Dagert M., Lanaud C.. 2009. Tree Genetics and Genomes, 5 : p. 329-337.

DOI: 10.1007/s11295-008-0185-6

Résumé

Article (a-revue à facteur d'impact)

A meta-QTL analysis of disease resistance traits of Theobroma cacao L.

Lanaud C., Fouet O., Clément D., Boccara M., Risterucci A.M., Surujdeo-Maharaj S., Legavre T., Argout X.. 2009. Molecular Breeding, 24 (4) : p. 361-374.

DOI: 10.1007/s11032-009-9297-4

Résumé

Article (a-revue à facteur d'impact)

Tracing the native ancestors of modern Theobroma cacao L. population in Ecuador

Loor Solorzano R.G., Risterucci A.M., Courtois B., Fouet O., Jeanneau M., Rosenquist E., Amores F., Vasco A., Medina M., Lanaud C.. 2009. Tree Genetics and Genomes, 5 (3) : p. 421-433.

DOI: 10.1007/s11295-008-0196-3

Résumé

Article (a-revue à facteur d'impact)

Expression des gènes intervenant dans la voie biosynthétique terpénoïde pendant le développement et la fermentation des semences de cacao

Sabau X., Loor R.G., Boccara M., Fouet O., Allègre M., Argout X., Legavre T., Risterucci A.M., Boulanger R., Lanaud C.. 2009. In : Towards rational cocoa production and efficient use for a sustainable word coca economy : 16th International Cocoa Resarch Conference = 16ème Conférence internationale sur la recherche cacaoyère, Bali, Indonésie, 16-21 novembre 2009. s.l. : s.n., p. 26-26. Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 16, 2009-11-16/2009-11-21, Bali (Indonésie).

Résumé

Communication de congrès

Towards the understanding of the cocoa transcriptome: Production and analysis of an exhaustive dataset of ESTs of Theobroma cacao L. generated from various tissues and under various conditions

Argout X., Fouet O., Wincker P., Gramacho K.P., Legavre T., Sabau X., Risterucci A.M., Da Silva C., Cascardo J.C.M., Allègre M., Kuhn D.N., Verica J., Courtois B., Loor R.G., Babin R., Sounigo O., Ducamp M., Guiltinan M.J., Ruiz M., Alemanno L., Machado R., Phillips W., Schnell R.J., Gilmour M., Rosenquist E., Butler D.R., Maximova S.N., Lanaud C.. 2008. BMC Genomics, 9 (512) : 19 p..

DOI: 10.1186/1471-2164-9-512

Résumé

Article (a-revue à facteur d'impact)

A first step in the understanding of the cocoa transcriptome: Analysis of an exhaustive dataset of ESTs on Theobroma cacao generated from various tissues and under various conditions

Argout X., Fouet O., Wincker P., Gramacho K.P., Legavre T., Sabau X., Risterucci A.M., Da Silva C., Loor Solorzano R.G., Cascardo J.C.M., Courtois B., Kuhn D.N., Schnell R.J., Babin R., Sounigo O., Ducamp M., Verica J., Guiltinan M.J., Alemanno L., Machado R., Phillips W., Maximova S.N., Lanaud C.. 2008. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XVIth Conference, San Diego, CA (USA), January 12-16, 2008. s.l. : s.n.. Plant and Animal Genomes Conference. 16, 2008-01-12/2008-01-16, San Diego (Etats-Unis).

Résumé

Communication de congrès

Geração de ests e identificação de marcadores SSR na interação cacau-Ceratocystis cacaofunesta

Santos R.M.F., Gramacho K.P., Lopes U.V., Argout X., Fouet O., Legavre T., Silva S.D.V.M., Lanaud C., Micheli F.. 2008. In : Resumos do 54e Congresso Brasileiro de Genética, 16 a 19 de setembro de 2008, Brasil. Brasilia : SBG, p. 292-292. Congresso Brasileiro de Genética. 54, 2008-09-16/2008-09-19, Salvador (Brésil).

Communication de congrès

Identification of Theobroma cacao genes differentially expressed during Phytophthora infection

Legavre T., Ducamp M., Sabau X., Argout X., Fouet O., Surujdeo-Maharaj S., Thévenin J.M., Lanaud C.. 2008. In : Seventh Plant Genomics European Meetings (Plant GEM), 24-27 September 2008, Albena, Bulgaria. s.l. : s.n., 1 p.. Plant Genomics European Meetings. 7, 2008-09-24/2008-09-27, Albena (Bulgarie).

Résumé

Communication de congrès

Integration of microsatellite (SSR) markers in Hevea spp. reference genetic map : a powerful tool for genetic analysis of qualitative and quantitative agronomic traits

Seguin M., Weber C., Fouet O., Rodier-Goud M.. 2008. In : IRRDB. 2008 IRRDB International Natural Rubber Conference and Annual Meetings, Kuala Lumpur, 13-14 October 2008. s.l. : s.n., p. 1-7. 2008 IRRDB International Natural Rubber Conference and Annual Meetings, 2008-10-13/2008-10-17, Kuala Lumpur (Malaisie).

Résumé

Communication de congrès

The International Cocoa Genome Sequencing Consortium (ICGS): a coordinated strategy to sequence and analyse Theobroma cacao genome [Draft]

Lanaud C., Argout X., Fouet O., Allègre M., Sidibé-Bocs S., Ruiz M., Kudrna D., Ssa J., Wing R.A., Clément D., Gramacho K.P., Tahi G.M., Brunel D., Bérard A., Boccara M., Udall J., Guiltinan M.J., Infante D., Costet P., Zang D., Risterucci A.M., Legavre T., Sabau X., Wincker P.. 2008. In : Seventh Plant Genomics European Meetings (Plant GEM), 24-27 September 2008, Albena, Bulgaria. s.l. : s.n., p. 1-16. Plant Genomics European Meetings. 7, 2008-09-24/2008-09-27, Albena (Bulgarie).

Communication de congrès

Adding value to cocoa (Theobroma cacao L.) germplasm information with domestication history and admixture mapping

Marcano M., Pugh T., Cros E., Morales S., Portillo E., Courtois B., Glaszmann J.C., Engels J.M.M., Phillips W., Astorga C., Risterucci A.M., Fouet O., Gonzalez V., Rosenberg K., Vallat I., Dagert M., Lanaud C.. 2007. Theoretical and Applied Genetics, 114 (5) : p. 877-884.

DOI: 10.1007/s00122-006-0486-9

Résumé

Article (a-revue à facteur d'impact)

A large EST resource for theobroma cacao L.

Lanaud C., Fouet O., Gramacho K.P., Argout X., Legavre T., Sabau X., Risterucci A.M., Wincker P., Da Silva C., Loor Solorzano R.G., Cascardo J.C.M., Courtois B., Kuhn D.N., Schnell R.J., Babin R., Sounigo O., Ducamp M., Deberdt P., Verica J., Guiltinan M.J., Alemanno L., Machado R., Philips W., Maximova S.N., Rosenquist E., Gilmour M., Glaszmann J.C.. 2007. In : Abstracts of Plant and Animal Genomes XVth Conference, San Diego, CA (USA), January 13-17, 2007. s.l. : s.n.. Plant and Animal Genomes Conference. 15, 2007-01-13/2007-01-17, San Diego (Etats-Unis).

Résumé

Communication de congrès

Identification of off-types of clones used in the International clone trial using DNA analyses

Sounigo O., Risterucci A.M., Clément D., Fouet O., Lanaud C.. 2006. In : Eskes Albertus (ed.), Efron Yoel (ed.). Global approaches to cocoa germplasm utilization and conservation : Final report of the CDC/CCO/IPGRI project on "Cocoa germplasm utilization and conservation: A global approach" (1998-2004). Amsterdam : CFC, p. 82-86. (CFC Technical paper, 50).

Résumé

Chapitre d'ouvrage

A new codominant marker-based cocoa linkage map : development and intergration of new microsatellite markers into cocoa linkage map. A new cocoa reference map

Pugh T., Fouet O., Risterucci A.M., Brottier P., Abouladze M., Delettrez C., Courtois B., Clément D., Larmande P., N'Goran J.A.K., Lanaud C.. 2005. In : 14th International Cocoa Research Conference. Proceedings : rumo a uma economia sustentavel do cacau - quais as estrategias para este fim ?. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, p. 153-160. Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 14, 2003-10-13/2003-10-18, Accra (Ghana).

Résumé

Communication de congrès

Identification of QTL related to fat content, seed size and sensorial traits in Theobroma cacao L.

Lanaud C., Boult E., Clapperton J., Koffi N.J.N., Cros E., Chapelin M., Risterucci A.M., Allaway D., Gillmore M., Cattaruzza A., Fouet O., Clément D., Petithuguenin P.. 2005. In : 14th International Cocoa Research Conference. Proceedings : rumo a uma economia sustentavel do cacau - quais as estrategias para este fim ?. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, p. 1119-1126. Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 14, 2003-10-13/2003-10-18, Accra (Ghana).

Résumé

Communication de congrès

A new cacao linkage map based on codominant markers : development and integration of 201 new microsatellite markers

Pugh T., Fouet O., Risterucci A.M., Brottier P., Abouladze M., Delettrez C., Courtois B., Clément D., Larmande P., N'Goran J.A.K., Lanaud C.. 2004. Theoretical and Applied Genetics, 108 (6) : p. 1151-1161.

DOI: 10.1007/s00122-003-1533-4

Résumé

Article (a-revue à facteur d'impact)

Creation of BAC genomic for cocoa (Theobroma cacao L.) for physical mapping of RGA containing BAC clones

Clément D., Lanaud C., Sabau X., Fouet O., Le Cunff L., Ruiz E., Risterucci A.M., Glaszmann J.C., Piffanelli P.. 2004. Theoretical and Applied Genetics, 108 (8) : p. 1627-1634.

DOI: 10.1007/s00122-004-1593-0

Résumé

Article (a-revue à facteur d'impact)

Bulk segregant analyses of (17-3/1 X 36-3/1) progeny for resistance to Phytophthora : preliminary results

Lanaud C., Paulin D., Clément D., Ducamp M., Fouet O., Vezian-Bonnemayre K., Efron Y., Risterucci A.M.. 2004. In : Cocoa germplasm improvement: global and participatory approaches. Rome : IPGRI, (9 vues). CFC/ICCO/IPGRI Projects Workshop, 2004-03-28/2004-04-03, Reading (Royaume-Uni).

Résumé

Communication de congrès

Genetic and physical mapping of resistance and defence gene analogs colocalised with QTL of resistance for Phytophthora in cocoa [ fruit trees. P 600]

Lanaud C., Clément D., Fouet O., Ruiz M., Le Cunff L., Risterucci A.M., Sabau X., Glaszmann J.C., Piffanelli P.. 2004. s.l. : s.n.. Plant and Animal Genomes Conference. 12, 2004-01-10/2004-01-14, San Diego (Etats-Unis).

Résumé

Communication de congrès

Development and integration of microsatellite markers into a molecular linkage cocoa map

Pugh-Moreno T., Fouet O., Risterucci A.M., Delettrez C., Courtois B., Larmande P., N'Goran J.A.K., Lanaud C.. 2003. s.l. : s.n.. Plant and Animal Genomes Conference. 11, 2003-01-11/2003-01-15, San Diego (Etats-Unis).

Résumé

Communication de congrès

Development and integration of new microsatellite markers into a cocoa linkage map : a new cocoa reference map [S04-27]

Pugh T., Fouet O., Risterucci A.M., Brottier P., Delettrez C., Courtois B., Larmande P., N'Goran J.A.K., Lanaud C.. 2003. In : 7th International Congress of Plant Molecular Biology, ISPMB 2003, Barcelona (Spain), June 23-28. Book of abstracts. Barcelone : ISPMB Office, p. 64-64. International Congress of Plant Molecular Biology. 7, 2003-06-23/2003-06-28, Barcelone (Espagne).

Résumé

Communication de congrès

Genetic and physical mapping of resistance and defence gene analogs colocalised with QTL of resistance for Phytophthora in cocoa

Lanaud C., Clément D., Fouet O., Ruiz M., Le Cunff L., Risterucci A.M., Sabau X., Glaszmann J.C., Piffanelli P.. 2003. In : 14th International Cocoa Research Conference, 13-18 October 2003, Accra, Ghana. Montpellier : Cirad, 1 p.. Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 14, 2003-10-13/2003-10-18, Accra (Ghana).

Résumé

Communication de congrès